More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4341 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4341  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
239 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0791  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  89.03 
 
 
239 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4182  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  89.45 
 
 
239 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.564485 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3858  sulfate/molybdate ABC transporter ATPase  89.03 
 
 
257 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177813  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3754  hypothetical protein  87.34 
 
 
239 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4090  hypothetical protein  89.03 
 
 
239 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.130099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  65.82 
 
 
359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  69.04 
 
 
356 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  65.82 
 
 
355 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
355 aa  317  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  64.98 
 
 
352 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  67.09 
 
 
359 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
356 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  67.09 
 
 
386 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
365 aa  315  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  63.29 
 
 
360 aa  315  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.56 
 
 
345 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  66.24 
 
 
374 aa  314  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  66.24 
 
 
348 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.14 
 
 
375 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  64.98 
 
 
343 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.56 
 
 
363 aa  310  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  62.03 
 
 
355 aa  310  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.56 
 
 
363 aa  310  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  63.71 
 
 
343 aa  310  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  62.87 
 
 
354 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  62.87 
 
 
362 aa  309  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.29 
 
 
373 aa  309  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.56 
 
 
364 aa  308  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.14 
 
 
363 aa  308  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.87 
 
 
362 aa  308  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.4 
 
 
348 aa  308  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.87 
 
 
375 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.87 
 
 
375 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.29 
 
 
374 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  63.71 
 
 
345 aa  307  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  62.87 
 
 
348 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.4 
 
 
347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.87 
 
 
371 aa  306  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.71 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  62.87 
 
 
348 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
357 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.29 
 
 
348 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 
354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.03 
 
 
354 aa  305  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.02 
 
 
351 aa  305  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 
365 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.98 
 
 
354 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.71 
 
 
365 aa  304  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.71 
 
 
365 aa  304  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.29 
 
 
362 aa  304  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 
369 aa  304  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.56 
 
 
367 aa  304  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.71 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  58.65 
 
 
329 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.56 
 
 
376 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.71 
 
 
365 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  62.45 
 
 
377 aa  303  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
346 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.71 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.14 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
330 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.14 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.14 
 
 
364 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  62.87 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.29 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.14 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  64.14 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.65 
 
 
357 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.34 
 
 
352 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  63.29 
 
 
365 aa  301  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  62.87 
 
 
349 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  63.29 
 
 
365 aa  301  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.03 
 
 
339 aa  301  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.29 
 
 
348 aa  301  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  58.65 
 
 
357 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.65 
 
 
357 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  58.65 
 
 
326 aa  300  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  60.34 
 
 
323 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.98 
 
 
240 aa  300  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  60.34 
 
 
367 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.85 
 
 
363 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  63.29 
 
 
348 aa  300  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.33 
 
 
352 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 
330 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  58.23 
 
 
326 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
352 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 
351 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.23 
 
 
329 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  66.36 
 
 
327 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  60.76 
 
 
372 aa  298  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.76 
 
 
369 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
329 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  59.49 
 
 
352 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  62.03 
 
 
349 aa  298  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 
332 aa  297  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
329 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 
330 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>