More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0185 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  99.65 
 
 
285 aa  577  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  67.14 
 
 
288 aa  411  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 
284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.32 
 
 
281 aa  328  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  50.73 
 
 
278 aa  304  9.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  50.36 
 
 
281 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  51.46 
 
 
281 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  52.99 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 
541 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
283 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  47.62 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 
284 aa  249  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
453 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 
440 aa  244  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.73 
 
 
278 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.01 
 
 
278 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.73 
 
 
282 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.17 
 
 
277 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  43.65 
 
 
398 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.22 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
456 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 
277 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
411 aa  231  9e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
395 aa  231  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.29 
 
 
277 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.7 
 
 
310 aa  228  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2189  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
271 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
285 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
403 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2355  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
271 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2196  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
271 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2242  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
271 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  normal  0.066673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2142  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
271 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
271 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
403 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
249 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  42.75 
 
 
380 aa  218  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.62 
 
 
252 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
243 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.9 
 
 
291 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 
285 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  41.53 
 
 
263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.08 
 
 
274 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
286 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  37.63 
 
 
290 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  41.41 
 
 
283 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.03 
 
 
285 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 
276 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  42.69 
 
 
276 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 
266 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  41.54 
 
 
282 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 
277 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.84 
 
 
259 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
255 aa  205  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.58 
 
 
271 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
283 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  38.15 
 
 
280 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
244 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.93 
 
 
286 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.21 
 
 
281 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
299 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  42.75 
 
 
286 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
279 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
247 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  39.61 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  42.91 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  42.91 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  39.61 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
273 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  41.27 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 
257 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.46 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
254 aa  195  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 
249 aa  195  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
568 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.56 
 
 
261 aa  193  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.1 
 
 
272 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
270 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
259 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  38.63 
 
 
281 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  40.08 
 
 
571 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.26 
 
 
280 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
256 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
252 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
253 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  40.23 
 
 
303 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 
249 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
290 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  37.11 
 
 
284 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 
270 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  38.85 
 
 
254 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>