More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0742 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0742  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0290801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  62.66 
 
 		 241 aa  324  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  62.24 
 
 		 241 aa  322  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  61.41 
 
 		 241 aa  321  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  62.66 
 
 		 241 aa  321  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  64.32 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  64.02 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  62.66 
 
 		 241 aa  318  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  64.08 
 
 		 265 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 		 246 aa  316  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  63.9 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.49 
 
 		 241 aa  314  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  63.49 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  63.9 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  63.67 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  60.17 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  63.49 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  63.49 
 
 		 241 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  63.03 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  63.49 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  64.29 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.66 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  62.24 
 
 		 241 aa  309  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  63.49 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  62.66 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  61.83 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  63.9 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  61.41 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  63.9 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.75 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  63.6 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  63.6 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  63.6 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  64.85 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  64.85 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  63.75 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  61.85 
 
 		 264 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  61 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  63.87 
 
 		 239 aa  304  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  64.02 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  64.02 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  59.34 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  63.37 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  62.24 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  65.98 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  62.76 
 
 		 243 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  61.41 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  61.41 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  62.04 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  62.04 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  63.49 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  58.75 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  60.66 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  60.82 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  61.83 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  62.76 
 
 		 243 aa  297  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.33 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  63.18 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.41 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  60 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  63.6 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  60.91 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  60.41 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  59.43 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  60.41 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>