More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1325 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1325  ABC transporter related  100 
 
 
521 aa  1036    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0870  ABC transporter related  43.36 
 
 
528 aa  360  3e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.865131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0683  ABC transporter related  43.37 
 
 
502 aa  359  7e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0416686 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  27.26 
 
 
571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  28.49 
 
 
571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  28.73 
 
 
572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  28.73 
 
 
572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  27.64 
 
 
564 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  27.64 
 
 
564 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  25.39 
 
 
568 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  24.39 
 
 
572 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
591 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.53 
 
 
600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  40.37 
 
 
613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
585 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  30.8 
 
 
724 aa  125  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  35.75 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  37.96 
 
 
608 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  26.53 
 
 
726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  26.71 
 
 
721 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.78 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  28.69 
 
 
720 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  30.72 
 
 
725 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  30.45 
 
 
724 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.41 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.85 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  25.97 
 
 
586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  28.6 
 
 
579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  30.24 
 
 
721 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.83 
 
 
999 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  27.32 
 
 
586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  30.28 
 
 
727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  25.32 
 
 
731 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  25.88 
 
 
606 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.97 
 
 
741 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  25.78 
 
 
586 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.97 
 
 
586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
1038 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
1038 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.22 
 
 
739 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.78 
 
 
586 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  28.79 
 
 
1675 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  33.51 
 
 
554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.85 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  26.86 
 
 
620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  25.14 
 
 
982 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  33.1 
 
 
579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.83 
 
 
580 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  27.32 
 
 
731 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.5 
 
 
638 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  26.51 
 
 
578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  26.36 
 
 
585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  26.51 
 
 
578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  31.77 
 
 
590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0694  ABC transporter related  24.59 
 
 
572 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  32.87 
 
 
370 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  34.98 
 
 
733 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.42 
 
 
720 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.12 
 
 
593 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1569  ABC transporter related  24.68 
 
 
572 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.44 
 
 
564 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.44 
 
 
587 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.53 
 
 
732 aa  113  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  29.46 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.42 
 
 
734 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.98 
 
 
567 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  34.63 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  38.14 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  26.1 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.31 
 
 
1008 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.31 
 
 
1008 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.05 
 
 
717 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.41 
 
 
590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  30.99 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  27.24 
 
 
705 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  26.87 
 
 
586 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.11 
 
 
980 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
726 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.4 
 
 
567 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.87 
 
 
586 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.83 
 
 
564 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.93 
 
 
1019 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.61 
 
 
564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.4 
 
 
567 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  28.44 
 
 
1717 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  26.05 
 
 
726 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  38.33 
 
 
745 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.48 
 
 
712 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.61 
 
 
586 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.05 
 
 
586 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  31.05 
 
 
590 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.8 
 
 
586 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  26.25 
 
 
714 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2702  ABC transporter related protein  31.42 
 
 
588 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000694566  normal  0.246929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  26.69 
 
 
586 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  29.72 
 
 
756 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.69 
 
 
586 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  31.19 
 
 
581 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.83 
 
 
581 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>