More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0552 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 588 aa  1193    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  32.55 
 
 		 577 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  30.94 
 
 		 572 aa  280  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  30.21 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 563 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.26 
 
 		 597 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.27 
 
 		 524 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  29.28 
 
 		 585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.17 
 
 		 1019 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  26.98 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  27.27 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  28.25 
 
 		 784 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  27.68 
 
 		 770 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  27.47 
 
 		 750 aa  197  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  28.22 
 
 		 584 aa  197  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  29.33 
 
 		 580 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  29.33 
 
 		 580 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.5 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  25.39 
 
 		 768 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  26.94 
 
 		 814 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  30.26 
 
 		 581 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  26.94 
 
 		 784 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.14 
 
 		 575 aa  193  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  26.24 
 
 		 582 aa  193  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  27.6 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  29.59 
 
 		 568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 1038 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1207  putative ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA  28.94 
 
 		 580 aa  191  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.272032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  29.21 
 
 		 596 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 1038 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  28.4 
 
 		 584 aa  190  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.55 
 
 		 738 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  27.69 
 
 		 764 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  28.38 
 
 		 624 aa  189  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  27.94 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.7 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  29.19 
 
 		 610 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  27.22 
 
 		 778 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.42 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  27.89 
 
 		 930 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.85 
 
 		 581 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  27.2 
 
 		 609 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  28.19 
 
 		 627 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  27.91 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.13 
 
 		 525 aa  187  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.22 
 
 		 734 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 		 578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.6 
 
 		 739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.53 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  27.02 
 
 		 773 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  30.5 
 
 		 980 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  26.04 
 
 		 638 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.38 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  28.78 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.06 
 
 		 768 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  28.66 
 
 		 602 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.54 
 
 		 586 aa  185  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  26.63 
 
 		 782 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1292  ABC transporter related  29.27 
 
 		 601 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  26.91 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.26 
 
 		 600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.1 
 
 		 601 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  28.57 
 
 		 582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.99 
 
 		 596 aa  183  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  26.98 
 
 		 808 aa  184  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.93 
 
 		 587 aa  184  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  28.97 
 
 		 572 aa  184  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  30 
 
 		 734 aa  183  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.92 
 
 		 598 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  27.74 
 
 		 612 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28 
 
 		 600 aa  183  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29 
 
 		 572 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  26.57 
 
 		 576 aa  183  9.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  27.05 
 
 		 760 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  28.18 
 
 		 628 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  27.3 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  26.84 
 
 		 601 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.43 
 
 		 593 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.18 
 
 		 605 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  26.36 
 
 		 618 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  26.63 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  27.85 
 
 		 595 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.52 
 
 		 976 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.51 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  27.66 
 
 		 572 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.47 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.98 
 
 		 971 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.39 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  26.68 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.69 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  25.61 
 
 		 613 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  28.97 
 
 		 619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.69 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.35 
 
 		 636 aa  181  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 1000 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  24.62 
 
 		 586 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  26.06 
 
 		 607 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  28.21 
 
 		 595 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  24.35 
 
 		 590 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>