More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1058 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 525 aa  1055    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.43 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.02 
 
 		 525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.16 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 		 588 aa  187  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  27.14 
 
 		 541 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 563 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  30.7 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  30.93 
 
 		 572 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  28.96 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.86 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.94 
 
 		 513 aa  149  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.57 
 
 		 544 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  27.06 
 
 		 621 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  25.93 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.51 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.84 
 
 		 529 aa  136  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  26.3 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  28.99 
 
 		 602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.62 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  28.77 
 
 		 591 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  25.49 
 
 		 704 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  23.61 
 
 		 571 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.27 
 
 		 595 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.39 
 
 		 583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  25.11 
 
 		 651 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.78 
 
 		 546 aa  126  9e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.4 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.94 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 597 aa  126  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  23.75 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2985  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.61 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2598  ABC transporter related  28.61 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.11 
 
 		 564 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.61 
 
 		 564 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.02 
 
 		 738 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.05 
 
 		 527 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  29.79 
 
 		 721 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.91 
 
 		 596 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.58 
 
 		 601 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  29.22 
 
 		 610 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  31.06 
 
 		 704 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0965  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  24.43 
 
 		 597 aa  123  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0998  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  24.63 
 
 		 599 aa  123  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  26.56 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  24.44 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  25.5 
 
 		 585 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  26.79 
 
 		 745 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  25.81 
 
 		 597 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  26.88 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.61 
 
 		 564 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.46 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  30.38 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  25.98 
 
 		 660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  24.94 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.27 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  26.82 
 
 		 619 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.67 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  27.82 
 
 		 610 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.53 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.08 
 
 		 593 aa  121  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.26 
 
 		 589 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  37.88 
 
 		 596 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  29.21 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  29.21 
 
 		 572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.79 
 
 		 555 aa  120  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  25.17 
 
 		 612 aa  120  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  28.36 
 
 		 716 aa  120  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.47 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  24.95 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  24.75 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  37.37 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 		 592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  25.1 
 
 		 620 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  34.76 
 
 		 571 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1370  ABC transporter related  33.47 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  22.64 
 
 		 615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  28.16 
 
 		 602 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  37.37 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  36.53 
 
 		 598 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  25.81 
 
 		 581 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  27.03 
 
 		 625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  25.27 
 
 		 609 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  28.1 
 
 		 584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 595 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1981  transport ATP-binding protein CydD  23.6 
 
 		 574 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.47079e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  30.68 
 
 		 609 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  38.38 
 
 		 647 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  34.13 
 
 		 601 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.67 
 
 		 572 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  25.55 
 
 		 606 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  33.1 
 
 		 589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.08 
 
 		 582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  24.08 
 
 		 574 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  24.08 
 
 		 574 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  24.22 
 
 		 574 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  31.56 
 
 		 590 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.79 
 
 		 582 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>