More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1525 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
528 aa  1063    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.05 
 
 
533 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  29.87 
 
 
541 aa  192  9e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.16 
 
 
525 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.88 
 
 
577 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.87 
 
 
525 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.23 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  27.11 
 
 
572 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.35 
 
 
546 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  25.58 
 
 
588 aa  150  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.46 
 
 
513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.49 
 
 
527 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  26.68 
 
 
527 aa  143  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.03 
 
 
544 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.99 
 
 
546 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  25.74 
 
 
613 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  26.67 
 
 
546 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.3 
 
 
524 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  24.77 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.03 
 
 
738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  25.81 
 
 
598 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.47 
 
 
526 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  24.89 
 
 
578 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  25.99 
 
 
455 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  24.01 
 
 
528 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  28.03 
 
 
613 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  27.17 
 
 
671 aa  121  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  25.6 
 
 
993 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0415  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  26.8 
 
 
570 aa  121  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.762356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13640  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  29.86 
 
 
574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.32 
 
 
575 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  26.48 
 
 
605 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.9 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.9 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 
597 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  36.71 
 
 
574 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.38 
 
 
564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.06 
 
 
582 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  25.47 
 
 
593 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  29.14 
 
 
716 aa  118  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.27 
 
 
527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0535  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
647 aa  117  5e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.55 
 
 
595 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.7 
 
 
583 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0215  ABC transporter related  28.09 
 
 
530 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.1 
 
 
625 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  21.62 
 
 
577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1739  ABC transporter, ATP-binding protein CydC  36.89 
 
 
582 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.257295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.18 
 
 
614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  23.08 
 
 
649 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.46 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.46 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.46 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1370  ABC transporter related  28.17 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1946  transport ATP-binding protein CydD  37.11 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  25.9 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  25.97 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.79 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.46 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.46 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3747  ABC transporter related  22.98 
 
 
565 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.903721  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  29.97 
 
 
564 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  29.97 
 
 
564 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  36.1 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  36.1 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  26.78 
 
 
566 aa  114  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  30.74 
 
 
590 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  29.63 
 
 
747 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  30.64 
 
 
588 aa  114  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.27 
 
 
593 aa  114  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  36.1 
 
 
574 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  28.83 
 
 
572 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  22.22 
 
 
715 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1981  transport ATP-binding protein CydD  28.6 
 
 
574 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.47079e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1054  ABC transporter related  25.28 
 
 
582 aa  113  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0245689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0508  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  22.78 
 
 
581 aa  113  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  30.99 
 
 
564 aa  113  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  35.87 
 
 
745 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  26.98 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  24.57 
 
 
597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  24.22 
 
 
721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.12 
 
 
582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1780  transport ATP-binding protein  36.1 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  26.57 
 
 
612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  26.3 
 
 
621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.17 
 
 
581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  24.82 
 
 
595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.2 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  23.68 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.2 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3382  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  36.08 
 
 
574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000301106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  25.77 
 
 
598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.83 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  28.83 
 
 
568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  25.59 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.31 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.2 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.2 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.2 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>