More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1829 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 525 aa  1053    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.02 
 
 		 525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.25 
 
 		 533 aa  261  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.87 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.41 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  26.75 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.5 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  28.18 
 
 		 572 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.44 
 
 		 524 aa  157  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 		 588 aa  156  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.4 
 
 		 563 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.79 
 
 		 529 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.15 
 
 		 527 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  26.77 
 
 		 527 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl118  multidrug ABC transporter  28.77 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  24.49 
 
 		 546 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  25.24 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.49 
 
 		 580 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  22.33 
 
 		 541 aa  123  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  28.22 
 
 		 566 aa  123  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.34 
 
 		 527 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.9 
 
 		 526 aa  120  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.05 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  25.12 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  22.34 
 
 		 626 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  24.9 
 
 		 704 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  25.72 
 
 		 554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.53 
 
 		 537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.12 
 
 		 637 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  26.4 
 
 		 727 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.02 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  25.95 
 
 		 704 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  25.52 
 
 		 589 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  29.38 
 
 		 554 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.32 
 
 		 544 aa  113  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  24.81 
 
 		 591 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 		 610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0881  ABC transporter related  25.3 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.435761  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  26.6 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  25.64 
 
 		 712 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  26.6 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  25.12 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.54 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1397  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  25.81 
 
 		 712 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  26.02 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.58 
 
 		 637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  24.68 
 
 		 566 aa  110  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  25.6 
 
 		 712 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  26.02 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  23.62 
 
 		 631 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  27.49 
 
 		 731 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  26.42 
 
 		 597 aa  109  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  22.75 
 
 		 718 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.77 
 
 		 720 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.75 
 
 		 722 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.5 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  25.66 
 
 		 621 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.01 
 
 		 589 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.3 
 
 		 734 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  31.79 
 
 		 1138 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.64 
 
 		 589 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  23.78 
 
 		 597 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  26.49 
 
 		 468 aa  107  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.89 
 
 		 571 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.42 
 
 		 739 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  23.54 
 
 		 595 aa  106  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  24.09 
 
 		 719 aa  106  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  26.95 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  25.93 
 
 		 602 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.83 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25.32 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  24.25 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  22.18 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.97 
 
 		 628 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  22.32 
 
 		 623 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  24.02 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  24.83 
 
 		 618 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.97 
 
 		 625 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3277  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family permease/ATP-binding protein CydC  33.49 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  23.51 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  23.31 
 
 		 528 aa  105  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.92 
 
 		 593 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  26.25 
 
 		 618 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.36 
 
 		 596 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.02 
 
 		 734 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.64 
 
 		 676 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1694  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.65 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0047408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  23.11 
 
 		 625 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  22.97 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  23.64 
 
 		 592 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  28.53 
 
 		 521 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.76 
 
 		 738 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.42 
 
 		 571 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.83 
 
 		 594 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  21.97 
 
 		 720 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  25.65 
 
 		 651 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.98 
 
 		 613 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  24.75 
 
 		 455 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>