More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0957 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 527 aa  1073    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.44 
 
 		 527 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.9 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.77 
 
 		 535 aa  311  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  28.09 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.82 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.42 
 
 		 529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  25.9 
 
 		 527 aa  134  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.62 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  27.06 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.38 
 
 		 524 aa  123  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.06 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.34 
 
 		 525 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  26.64 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.62 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.49 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  25.62 
 
 		 596 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  22.54 
 
 		 572 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  23.79 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  21.56 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  24.07 
 
 		 577 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  25.75 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  25.45 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.27 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3634  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.28 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0556966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  24.03 
 
 		 564 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.14 
 
 		 608 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  24.71 
 
 		 598 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3673  ABC transporter related  34.55 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3639  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.28 
 
 		 549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  23.8 
 
 		 564 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  28.57 
 
 		 725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  25.91 
 
 		 715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  24.88 
 
 		 583 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3347  ABC transporter related  35.52 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.318773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.8 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3626  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.8 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.39 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  25.25 
 
 		 598 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  32.55 
 
 		 725 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  25.16 
 
 		 776 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  25.19 
 
 		 552 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3474  ABC transporter related  34.74 
 
 		 525 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  23.35 
 
 		 734 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  27.89 
 
 		 725 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  25.06 
 
 		 704 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  27.84 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.1 
 
 		 627 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  23.11 
 
 		 585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  29.15 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  27.24 
 
 		 725 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.56 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.41 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  24.52 
 
 		 726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.23 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  27.24 
 
 		 576 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  27.49 
 
 		 609 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  23.58 
 
 		 725 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  24.06 
 
 		 592 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.56 
 
 		 564 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  25 
 
 		 704 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.09 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.09 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 		 632 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  24.82 
 
 		 725 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.34 
 
 		 614 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  34.08 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  25 
 
 		 723 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  31.58 
 
 		 726 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.8 
 
 		 564 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  23.58 
 
 		 725 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.15 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  23.58 
 
 		 725 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  23.74 
 
 		 886 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.63 
 
 		 586 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  23.31 
 
 		 580 aa  110  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1739  ABC transporter, ATP-binding protein CydC  36.54 
 
 		 582 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.257295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  30.05 
 
 		 610 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  23.36 
 
 		 725 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.86 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.88 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.16 
 
 		 625 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.67 
 
 		 634 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0535  ABC transporter related protein  23.87 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.58 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2418  ABC transporter, transmembrane region, type 1  27.72 
 
 		 579 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0870797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  28.67 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  24.21 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  31.86 
 
 		 723 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  31.86 
 
 		 723 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  23.49 
 
 		 726 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1594  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.89 
 
 		 549 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.427378  hitchhiker  0.00203271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  22.63 
 
 		 586 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3319  ABC transporter, ATP-binding/permease  23.42 
 
 		 545 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  24.86 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  29.63 
 
 		 727 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.77 
 
 		 639 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  32 
 
 		 584 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  23.26 
 
 		 726 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3301  ABC transporter related  24.39 
 
 		 571 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>