More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1134 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  100 
 
 		 527 aa  1049    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.22 
 
 		 529 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.49 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.43 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.74 
 
 		 522 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.99 
 
 		 544 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  30.68 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.64 
 
 		 577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  25.64 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  26.73 
 
 		 526 aa  156  9e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  29.01 
 
 		 546 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  26.3 
 
 		 554 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.22 
 
 		 580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.03 
 
 		 563 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  26.74 
 
 		 572 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.74 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.68 
 
 		 528 aa  143  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  26.36 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  25.46 
 
 		 546 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.02 
 
 		 527 aa  137  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  24.38 
 
 		 576 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.9 
 
 		 527 aa  134  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  26.06 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  24.07 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.77 
 
 		 525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  23.75 
 
 		 587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.11 
 
 		 526 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  24.91 
 
 		 615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.25 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.04 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  25.55 
 
 		 619 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  24.4 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  26.68 
 
 		 579 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.13 
 
 		 598 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  24.85 
 
 		 596 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  21.05 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  26.19 
 
 		 608 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.52 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  24.36 
 
 		 596 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.67 
 
 		 598 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  22.98 
 
 		 625 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.34 
 
 		 533 aa  123  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  21.59 
 
 		 1522 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  25.11 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.72 
 
 		 598 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.11 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.88 
 
 		 525 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.11 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.11 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.11 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.11 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  19.09 
 
 		 1257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  25.27 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.11 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.11 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.72 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.89 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  23.74 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.89 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  22.5 
 
 		 588 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  22.73 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21 
 
 		 622 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  23.72 
 
 		 598 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.72 
 
 		 598 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.72 
 
 		 598 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.72 
 
 		 598 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 608 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  25.62 
 
 		 619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  23.87 
 
 		 605 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  24.51 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  24.89 
 
 		 614 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  23.87 
 
 		 595 aa  120  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  22.83 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  26.83 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  21.46 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.52 
 
 		 608 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  22.37 
 
 		 612 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  26.83 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  24.29 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  21.95 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.94 
 
 		 575 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  25.61 
 
 		 603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  22.14 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.14 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.14 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.14 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  23.58 
 
 		 591 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  21.95 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  22.24 
 
 		 609 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  21.95 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  21.43 
 
 		 590 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  21.95 
 
 		 593 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  21.63 
 
 		 590 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  26.21 
 
 		 572 aa  117  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  22.95 
 
 		 593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  35.5 
 
 		 564 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  21.44 
 
 		 654 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  22.58 
 
 		 614 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  23.75 
 
 		 590 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  26.12 
 
 		 617 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>