More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0246 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 
590 aa  1170    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  90 
 
 
590 aa  1064    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  99.49 
 
 
590 aa  1165    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  62 
 
 
579 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1984  ABC transporter related  51.99 
 
 
619 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.434554  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.46 
 
 
582 aa  359  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.44 
 
 
585 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.91 
 
 
580 aa  350  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.38 
 
 
580 aa  346  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 
571 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.96 
 
 
583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  36.56 
 
 
589 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 
571 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  36.14 
 
 
605 aa  339  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.15 
 
 
572 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.86 
 
 
579 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.75 
 
 
600 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  35.99 
 
 
609 aa  327  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.75 
 
 
594 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
598 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  35.01 
 
 
618 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  35.96 
 
 
588 aa  320  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  32.14 
 
 
572 aa  320  6e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.7 
 
 
583 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.83 
 
 
627 aa  319  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.4 
 
 
596 aa  319  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.24 
 
 
593 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 
582 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.36 
 
 
609 aa  317  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.09 
 
 
593 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.81 
 
 
597 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  39.27 
 
 
597 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  39.27 
 
 
597 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.54 
 
 
587 aa  316  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4587  ABC transporter related  37.7 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156364  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.08 
 
 
623 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.43 
 
 
591 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.22 
 
 
583 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.78 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.38 
 
 
587 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.36 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.59 
 
 
574 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.59 
 
 
574 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  38.81 
 
 
596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  31.82 
 
 
566 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.54 
 
 
601 aa  312  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.47 
 
 
602 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  37.59 
 
 
595 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  33.62 
 
 
593 aa  310  4e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  36.38 
 
 
624 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.04 
 
 
577 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.95 
 
 
594 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  35.7 
 
 
592 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.69 
 
 
594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.41 
 
 
597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  37.32 
 
 
595 aa  308  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  35.36 
 
 
582 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.07 
 
 
597 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.28 
 
 
579 aa  306  9.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  35.92 
 
 
601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  38.03 
 
 
586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  34.74 
 
 
600 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.18 
 
 
582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
574 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.83 
 
 
575 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.83 
 
 
575 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.83 
 
 
574 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
575 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
596 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
596 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  32.97 
 
 
580 aa  302  9e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  32.97 
 
 
580 aa  302  9e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3027  ABC transporter related  36.45 
 
 
572 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344484  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.46 
 
 
596 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.14 
 
 
597 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.52 
 
 
590 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.64 
 
 
574 aa  300  6e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.76 
 
 
594 aa  300  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  34.54 
 
 
596 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1398  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.86 
 
 
582 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.86 
 
 
588 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.1 
 
 
556 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.11 
 
 
582 aa  298  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1010  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.13 
 
 
629 aa  297  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  37.81 
 
 
600 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.8 
 
 
639 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  34.7 
 
 
601 aa  297  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.2 
 
 
616 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.21 
 
 
605 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 
582 aa  296  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  34.62 
 
 
579 aa  296  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.33 
 
 
632 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  32.83 
 
 
599 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.78 
 
 
583 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  37.28 
 
 
611 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.77 
 
 
586 aa  295  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  37.52 
 
 
579 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  33.76 
 
 
632 aa  293  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  37.93 
 
 
600 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1292  ABC transporter related  33.83 
 
 
601 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>