More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3561 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 579 aa  1137    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  48.7 
 
 		 605 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.59 
 
 		 585 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.43 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  43.78 
 
 		 627 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  43.4 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.63 
 
 		 580 aa  432  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.39 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  41.92 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.61 
 
 		 582 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 611 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  40.21 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  42.02 
 
 		 611 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.76 
 
 		 602 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.58 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.75 
 
 		 580 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  38.54 
 
 		 589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.85 
 
 		 600 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.02 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  38.47 
 
 		 609 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.38 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  37.54 
 
 		 588 aa  399  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  38.94 
 
 		 595 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.38 
 
 		 591 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.37 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  39.73 
 
 		 595 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  38.33 
 
 		 618 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  39.44 
 
 		 601 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  40.03 
 
 		 601 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  44.52 
 
 		 586 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  43.11 
 
 		 588 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  40.9 
 
 		 596 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  39.24 
 
 		 624 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.57 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  43.83 
 
 		 596 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  37.8 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4230  ABC transporter related  39.55 
 
 		 621 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  41.52 
 
 		 601 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  43.11 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  43.11 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  41.57 
 
 		 579 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4587  ABC transporter related  43.71 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.85 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.83 
 
 		 582 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3027  ABC transporter related  43.54 
 
 		 572 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344484  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 598 aa  362  7.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3016  ABC transporter related  40.73 
 
 		 605 aa  362  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  39.75 
 
 		 600 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.13 
 
 		 582 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.52 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.77 
 
 		 583 aa  359  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.37 
 
 		 583 aa  359  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  39.18 
 
 		 600 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.23 
 
 		 587 aa  357  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.03 
 
 		 582 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.69 
 
 		 596 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  35.87 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.36 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.49 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.49 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.49 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.49 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  35.13 
 
 		 613 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.49 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.38 
 
 		 588 aa  354  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.9 
 
 		 597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  36.31 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.46 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.38 
 
 		 582 aa  352  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 582 aa  351  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  35.59 
 
 		 603 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2763  transport ATP-binding protein msbA  39.44 
 
 		 590 aa  349  9e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.714351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.68 
 
 		 613 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.45 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.45 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  34.03 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  40.71 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  38.57 
 
 		 579 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.21 
 
 		 587 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.21 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.4 
 
 		 582 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  35.49 
 
 		 585 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.66 
 
 		 605 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  40.33 
 
 		 582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  39.54 
 
 		 598 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.37 
 
 		 578 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.37 
 
 		 578 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  39.5 
 
 		 597 aa  342  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>