More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5589 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3027  ABC transporter related  61.75 
 
 		 572 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344484  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  82.19 
 
 		 597 aa  889    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  100 
 
 		 586 aa  1140    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4587  ABC transporter related  61.96 
 
 		 587 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  83.22 
 
 		 596 aa  894    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  82.02 
 
 		 597 aa  887    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  47.99 
 
 		 579 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  46.26 
 
 		 588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3016  ABC transporter related  49.21 
 
 		 605 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  45.08 
 
 		 605 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  42.56 
 
 		 627 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.26 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  40.75 
 
 		 611 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.93 
 
 		 577 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  40.17 
 
 		 611 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  43.06 
 
 		 596 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  44.33 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 		 611 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.34 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.48 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.78 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  38.3 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.06 
 
 		 583 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.06 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.28 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  41.1 
 
 		 600 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.11 
 
 		 591 aa  369  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  41.23 
 
 		 602 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  39.71 
 
 		 624 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.04 
 
 		 587 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4230  ABC transporter related  39.76 
 
 		 621 aa  362  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.91 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.75 
 
 		 601 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.93 
 
 		 588 aa  359  7e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  36.66 
 
 		 618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  41.13 
 
 		 600 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  39.8 
 
 		 598 aa  357  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  37.8 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  39.83 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.53 
 
 		 580 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  38.73 
 
 		 600 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  39.63 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.79 
 
 		 597 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.47 
 
 		 582 aa  352  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  38.81 
 
 		 595 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.22 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  41.35 
 
 		 601 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  38.81 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.22 
 
 		 574 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  40.64 
 
 		 600 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 		 571 aa  351  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 		 592 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.53 
 
 		 580 aa  349  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.26 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  40.24 
 
 		 598 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1292  ABC transporter related  39.33 
 
 		 601 aa  347  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  38.04 
 
 		 601 aa  346  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.39 
 
 		 594 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.03 
 
 		 590 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.87 
 
 		 579 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  37.28 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.49 
 
 		 582 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  38.03 
 
 		 590 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  38.71 
 
 		 601 aa  342  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  38.88 
 
 		 590 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.33 
 
 		 602 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.46 
 
 		 606 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.19 
 
 		 600 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  35.92 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.12 
 
 		 556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.91 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.01 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.61 
 
 		 594 aa  337  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  37.81 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  34.98 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.88 
 
 		 583 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.2 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.2 
 
 		 623 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.04 
 
 		 583 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.94 
 
 		 587 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.21 
 
 		 583 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.51 
 
 		 581 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.65 
 
 		 587 aa  333  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.38 
 
 		 583 aa  333  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>