More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0117 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  100 
 
 
574 aa  1152    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0580  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  62.61 
 
 
571 aa  670    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  63.32 
 
 
571 aa  724    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0629  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  60.32 
 
 
587 aa  674    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  78.21 
 
 
586 aa  926    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  71.68 
 
 
572 aa  818    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1207  putative ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA  54.2 
 
 
580 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.272032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  54.37 
 
 
580 aa  611  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  54.37 
 
 
580 aa  611  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  50.18 
 
 
566 aa  593  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.77 
 
 
577 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  41.2 
 
 
588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  38.8 
 
 
618 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.34 
 
 
585 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.46 
 
 
572 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.37 
 
 
600 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.76 
 
 
602 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.56 
 
 
580 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.1 
 
 
582 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  38.03 
 
 
571 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.08 
 
 
580 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 
571 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.62 
 
 
583 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  38.45 
 
 
601 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.7 
 
 
611 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  37.17 
 
 
579 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  38.69 
 
 
589 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 
611 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  37.02 
 
 
611 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.82 
 
 
611 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.22 
 
 
587 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  40.38 
 
 
556 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.39 
 
 
597 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  35.04 
 
 
605 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.98 
 
 
582 aa  359  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.04 
 
 
582 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.16 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.56 
 
 
596 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.22 
 
 
587 aa  353  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.81 
 
 
581 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.09 
 
 
579 aa  352  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.44 
 
 
627 aa  350  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.22 
 
 
581 aa  349  9e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.85 
 
 
596 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.92 
 
 
597 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 
582 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 
582 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  33.22 
 
 
601 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 
582 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 
582 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 
582 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.04 
 
 
582 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
591 aa  347  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.56 
 
 
582 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.07 
 
 
609 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  34.17 
 
 
624 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  34.78 
 
 
602 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.86 
 
 
585 aa  343  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0735  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.63 
 
 
582 aa  343  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.65 
 
 
592 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.27 
 
 
583 aa  343  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.03 
 
 
582 aa  342  9e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.03 
 
 
582 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.04 
 
 
582 aa  342  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.03 
 
 
582 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.63 
 
 
597 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  31.85 
 
 
582 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  33.39 
 
 
595 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.38 
 
 
594 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.07 
 
 
579 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  32.26 
 
 
609 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  33.11 
 
 
604 aa  340  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
582 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.92 
 
 
597 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  37.05 
 
 
593 aa  339  7e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
598 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  32.61 
 
 
588 aa  339  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  32.61 
 
 
596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  36.33 
 
 
608 aa  337  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  36.45 
 
 
609 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.09 
 
 
593 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.08 
 
 
597 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.09 
 
 
583 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
587 aa  335  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  32.5 
 
 
595 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.1 
 
 
589 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  33.33 
 
 
601 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0983  ABC transporter, ATP-binding protein, MsbA family  32.58 
 
 
562 aa  334  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.22 
 
 
574 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1097  ABC transporter related  32.58 
 
 
562 aa  334  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.22 
 
 
574 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  38.53 
 
 
578 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>