More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1038 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 526 aa  1072    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.22 
 
 		 535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.9 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.1 
 
 		 527 aa  323  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.16 
 
 		 529 aa  159  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.8 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.39 
 
 		 544 aa  150  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  24.66 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  25.22 
 
 		 546 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  24.5 
 
 		 572 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.22 
 
 		 596 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.69 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  22.11 
 
 		 527 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  26.4 
 
 		 610 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  27.65 
 
 		 610 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  27.65 
 
 		 610 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  28.72 
 
 		 726 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.47 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.51 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.64 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  26.49 
 
 		 610 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.53 
 
 		 537 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  27.51 
 
 		 650 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  25.88 
 
 		 621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0069  ABC transporter-related protein  27.38 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.590448  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  22.92 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  24.3 
 
 		 593 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.9 
 
 		 525 aa  120  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  25.28 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  22.54 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.14 
 
 		 621 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.67 
 
 		 1019 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  22.67 
 
 		 587 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  26.58 
 
 		 648 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  24.58 
 
 		 582 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  25.68 
 
 		 608 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  24.19 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  24.77 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.59 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  23.96 
 
 		 573 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  26.21 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.51 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.51 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  20.97 
 
 		 584 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl118  multidrug ABC transporter  24.86 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  25.47 
 
 		 595 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  24.4 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 		 594 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  23.03 
 
 		 586 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  26.21 
 
 		 597 aa  113  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.89 
 
 		 589 aa  113  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.55 
 
 		 608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3474  ABC transporter related  24.71 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  23.2 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  21.69 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  23.26 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  24.04 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  23.2 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  26.09 
 
 		 715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  24.4 
 
 		 1038 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  25.71 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.21 
 
 		 593 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  25.71 
 
 		 571 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  24.4 
 
 		 1038 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  26.91 
 
 		 596 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  27.68 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02986  ABC transporter, ATP-binding protein  29.45 
 
 		 667 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  24.83 
 
 		 591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.03 
 
 		 555 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  22.96 
 
 		 622 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  26.94 
 
 		 586 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.16 
 
 		 564 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  26.94 
 
 		 596 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  23.22 
 
 		 552 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1811  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  24.52 
 
 		 573 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.404009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1805  transport ATP-binding protein CydC  24.29 
 
 		 571 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1945  transport ATP-binding protein CydC  24.29 
 
 		 571 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.26 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  23.4 
 
 		 602 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  27.03 
 
 		 975 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  25.66 
 
 		 585 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1635  ABC transporter related  24.16 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2044  transport ATP-binding protein CydC  24.59 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298997  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  26.91 
 
 		 701 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  26.96 
 
 		 643 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  35.9 
 
 		 550 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  23.4 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.16 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.82 
 
 		 576 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3383  transport ATP-binding protein CydC  25.19 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.813742  hitchhiker  0.00000000000619034 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  25.13 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1779  ABC transporter, ATP-binding and permease  24.06 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  20.53 
 
 		 602 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  28.85 
 
 		 705 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>