More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1498 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  100 
 
 
571 aa  1148    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  82.75 
 
 
572 aa  952    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  82.75 
 
 
572 aa  952    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  99.3 
 
 
571 aa  1140    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  54.64 
 
 
564 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  54.64 
 
 
564 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  34.99 
 
 
572 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  38.52 
 
 
568 aa  310  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.43 
 
 
578 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  29.98 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.51 
 
 
600 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.35 
 
 
586 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.66 
 
 
578 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.66 
 
 
578 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.77 
 
 
580 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.19 
 
 
597 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.47 
 
 
586 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.98 
 
 
598 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.3 
 
 
586 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1052  ABC transporter related  53.42 
 
 
220 aa  226  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  27.84 
 
 
586 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.13 
 
 
586 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.13 
 
 
586 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.22 
 
 
586 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.22 
 
 
586 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.62 
 
 
573 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  30.53 
 
 
712 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  27.96 
 
 
586 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
586 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.43 
 
 
588 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.22 
 
 
588 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
586 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.52 
 
 
583 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.84 
 
 
586 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.79 
 
 
597 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.76 
 
 
583 aa  224  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  30.36 
 
 
712 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.72 
 
 
586 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  27.62 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.94 
 
 
585 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.28 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.05 
 
 
586 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  29.73 
 
 
712 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.14 
 
 
556 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  30.72 
 
 
610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.55 
 
 
586 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.73 
 
 
577 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  29.34 
 
 
627 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.22 
 
 
575 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  29.18 
 
 
614 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.48 
 
 
724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.73 
 
 
589 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.48 
 
 
724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  29.6 
 
 
586 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  32.3 
 
 
609 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  28.77 
 
 
586 aa  216  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30 
 
 
584 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  30.02 
 
 
773 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.58 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30.46 
 
 
612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.38 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  28.67 
 
 
699 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  30.34 
 
 
593 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.73 
 
 
581 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.2 
 
 
598 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  30.21 
 
 
611 aa  213  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  31.93 
 
 
764 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.65 
 
 
594 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  29.09 
 
 
583 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  31.26 
 
 
585 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.41 
 
 
727 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  30.2 
 
 
582 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.53 
 
 
592 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.74 
 
 
865 aa  211  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  32.24 
 
 
613 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  27.91 
 
 
633 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.42 
 
 
582 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.78 
 
 
617 aa  210  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.95 
 
 
593 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  30.23 
 
 
701 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.78 
 
 
597 aa  210  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  31.41 
 
 
603 aa  210  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  30 
 
 
601 aa  210  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.12 
 
 
597 aa  210  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.27 
 
 
720 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  27.56 
 
 
586 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  27.79 
 
 
592 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 
604 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  28.6 
 
 
571 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  29.01 
 
 
610 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  29.4 
 
 
556 aa  209  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  31.49 
 
 
573 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.62 
 
 
606 aa  207  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  31.65 
 
 
603 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  27.72 
 
 
611 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  28.9 
 
 
631 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  29.84 
 
 
608 aa  208  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  40.25 
 
 
577 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  28.62 
 
 
589 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>