More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1355 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  100 
 
 
546 aa  1088    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  89.93 
 
 
572 aa  985    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  34.55 
 
 
577 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.04 
 
 
563 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.01 
 
 
524 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 
588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  31.99 
 
 
541 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.16 
 
 
529 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  31.83 
 
 
546 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  29.22 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.94 
 
 
727 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.49 
 
 
572 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.6 
 
 
579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.34 
 
 
581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.88 
 
 
581 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.88 
 
 
613 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.9 
 
 
578 aa  183  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.96 
 
 
582 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  26.6 
 
 
578 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  28.1 
 
 
618 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  26.6 
 
 
578 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.91 
 
 
575 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.15 
 
 
587 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.87 
 
 
717 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  28.4 
 
 
586 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 
566 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
582 aa  181  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  30 
 
 
566 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  27.52 
 
 
613 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.32 
 
 
556 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.02 
 
 
566 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
573 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  28.89 
 
 
596 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.49 
 
 
572 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  31.37 
 
 
559 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.23 
 
 
581 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  28.51 
 
 
600 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  27 
 
 
578 aa  178  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  30.84 
 
 
582 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.7 
 
 
597 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  30.84 
 
 
582 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  29.03 
 
 
608 aa  177  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.76 
 
 
582 aa  177  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  28.54 
 
 
567 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.9 
 
 
727 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.2 
 
 
597 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.45 
 
 
567 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.52 
 
 
582 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.2 
 
 
597 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.1 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.26 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  28.57 
 
 
582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  25.77 
 
 
599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.32 
 
 
759 aa  174  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.29 
 
 
600 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  30.48 
 
 
760 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.02 
 
 
738 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.39 
 
 
597 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.41 
 
 
608 aa  173  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.05 
 
 
597 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.71 
 
 
578 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.13 
 
 
597 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  26.04 
 
 
603 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  27.37 
 
 
628 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.29 
 
 
583 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.82 
 
 
602 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.8 
 
 
597 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  24.08 
 
 
581 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  30.87 
 
 
613 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.5 
 
 
582 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  26.93 
 
 
620 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  28.9 
 
 
610 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.99 
 
 
594 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.05 
 
 
583 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  25.85 
 
 
613 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.27 
 
 
598 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.72 
 
 
600 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  27.48 
 
 
604 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  27.74 
 
 
596 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  27.22 
 
 
590 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  27.54 
 
 
617 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.82 
 
 
602 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  28.21 
 
 
526 aa  171  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  26.17 
 
 
603 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>