More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1925 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
513 aa  1050    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.5 
 
 
525 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  26.17 
 
 
572 aa  150  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.94 
 
 
525 aa  149  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.46 
 
 
528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.89 
 
 
533 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  27.14 
 
 
546 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  24.53 
 
 
588 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.69 
 
 
526 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  22.9 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0215  ABC transporter related  27.4 
 
 
530 aa  117  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.98 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.89 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  24.64 
 
 
526 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  26.68 
 
 
530 aa  111  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  22.06 
 
 
563 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1054  ABC transporter related  26.03 
 
 
582 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0245689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.6 
 
 
529 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  24.53 
 
 
534 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.1 
 
 
535 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  25 
 
 
566 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.93 
 
 
610 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  23.3 
 
 
599 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  23.35 
 
 
585 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  22.82 
 
 
589 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2165  ABC transporter related  25.77 
 
 
581 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663774  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  36.13 
 
 
235 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0415  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  24.58 
 
 
570 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.75 
 
 
564 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.75 
 
 
564 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.87 
 
 
593 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  21.68 
 
 
554 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0694  ABC transporter related  25.56 
 
 
572 aa  104  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  36.79 
 
 
236 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  33.83 
 
 
232 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  25.36 
 
 
572 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1003  ABC transporter related  22.92 
 
 
565 aa  103  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3634  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.95 
 
 
549 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0556966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3626  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.41 
 
 
549 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  24.36 
 
 
564 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  37.22 
 
 
233 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 
228 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3639  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.48 
 
 
549 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  34.03 
 
 
216 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.14 
 
 
544 aa  103  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.91 
 
 
605 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1311  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25 
 
 
534 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.66 
 
 
524 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  32.71 
 
 
683 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.82 
 
 
226 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.18 
 
 
227 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  34.52 
 
 
248 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  29.53 
 
 
571 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  32.41 
 
 
369 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.82 
 
 
226 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  22.25 
 
 
577 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  32.41 
 
 
369 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
564 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  23.44 
 
 
564 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.44 
 
 
549 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.83 
 
 
230 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  24.32 
 
 
595 aa  101  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.79 
 
 
589 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3684  ABC transporter related  21.72 
 
 
714 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.85 
 
 
610 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl118  multidrug ABC transporter  26.2 
 
 
529 aa  100  5e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  24.72 
 
 
580 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.57 
 
 
258 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
229 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  22.3 
 
 
611 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  33.01 
 
 
369 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  33.01 
 
 
369 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  33.01 
 
 
369 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  33.33 
 
 
225 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  34.01 
 
 
229 aa  100  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.23 
 
 
594 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  22.3 
 
 
581 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 
229 aa  100  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  35.35 
 
 
484 aa  100  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  20.66 
 
 
608 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.56 
 
 
594 aa  100  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  34.43 
 
 
305 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  35 
 
 
225 aa  99.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 
221 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.51 
 
 
546 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  22.35 
 
 
571 aa  99.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2300  ABC transporter related  35.1 
 
 
222 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0060  ABC transporter related  35.11 
 
 
235 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.235651  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  38.95 
 
 
226 aa  99  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  34.55 
 
 
235 aa  99  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  22.41 
 
 
571 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2501  ATPase  23.99 
 
 
917 aa  98.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608162  normal  0.380324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.79 
 
 
632 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  22.97 
 
 
596 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1569  ABC transporter related  24 
 
 
572 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.66 
 
 
232 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  23.94 
 
 
575 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  23.41 
 
 
577 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.95 
 
 
226 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0490  ABC transporter related  33.66 
 
 
241 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>