More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1054 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1054  ABC transporter related  100 
 
 
582 aa  1172    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0245689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  26.29 
 
 
610 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.29 
 
 
609 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  27.73 
 
 
602 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  23.98 
 
 
671 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  24.34 
 
 
633 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  26.84 
 
 
572 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  25.68 
 
 
578 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  25.68 
 
 
578 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  24.77 
 
 
579 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  25.72 
 
 
606 aa  144  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.11 
 
 
582 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.75 
 
 
622 aa  144  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.65 
 
 
637 aa  143  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 
598 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  24.3 
 
 
634 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.58 
 
 
564 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.46 
 
 
637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.82 
 
 
598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.7 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.1 
 
 
564 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  24.65 
 
 
650 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  28.5 
 
 
602 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  24.65 
 
 
650 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  26.68 
 
 
610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  27.74 
 
 
610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  27.74 
 
 
610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  23.49 
 
 
584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.29 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.76 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.62 
 
 
564 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  24.63 
 
 
636 aa  140  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  25.87 
 
 
583 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  27.75 
 
 
590 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  23.71 
 
 
631 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  27.4 
 
 
590 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.12 
 
 
586 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.91 
 
 
598 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  25.23 
 
 
589 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  25.69 
 
 
616 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  24.01 
 
 
580 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.06 
 
 
586 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.06 
 
 
586 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  24.82 
 
 
641 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  26.85 
 
 
602 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.06 
 
 
586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.46 
 
 
598 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  26.48 
 
 
779 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  26.06 
 
 
586 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  26.62 
 
 
584 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.06 
 
 
586 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  28.66 
 
 
598 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  27.54 
 
 
1179 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  24.26 
 
 
586 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 
578 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.36 
 
 
1257 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  22.58 
 
 
695 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  24.41 
 
 
733 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  27.11 
 
 
588 aa  137  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  29.78 
 
 
584 aa  137  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  26.86 
 
 
593 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.55 
 
 
586 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  26.12 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.55 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  27.64 
 
 
590 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  27.79 
 
 
1231 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.49 
 
 
865 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  32.45 
 
 
582 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  26.86 
 
 
1179 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.97 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  23.8 
 
 
584 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  22.77 
 
 
649 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  26.86 
 
 
1179 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  25.2 
 
 
574 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.97 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  23.57 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  24.17 
 
 
615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  23.48 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  23.48 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  30.77 
 
 
871 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1984  ABC transporter related  26.71 
 
 
619 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.434554  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  23.84 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  23.48 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  22.05 
 
 
669 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  23.48 
 
 
725 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.23 
 
 
589 aa  135  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  26.5 
 
 
595 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  27.64 
 
 
738 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.79 
 
 
677 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.2 
 
 
580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  23.93 
 
 
598 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  25.05 
 
 
625 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  23.83 
 
 
726 aa  134  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.25 
 
 
583 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  23.39 
 
 
723 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.61 
 
 
586 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  23.67 
 
 
728 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  23.09 
 
 
762 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  26.55 
 
 
737 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1010  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.24 
 
 
629 aa  133  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>