More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2300 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2300  ABC transporter related  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1571  ABC transporter related protein  83.33 
 
 
220 aa  343  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0043  ABC transporter related  54.29 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.61103  normal  0.243763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2628  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
215 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  41.63 
 
 
232 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  38.89 
 
 
225 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  41.43 
 
 
230 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  38.33 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  43.16 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.82 
 
 
216 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  41.9 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.65 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  37.63 
 
 
230 aa  131  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  37.31 
 
 
224 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  41.34 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
229 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
224 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  38.55 
 
 
227 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  37.85 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  41.34 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  36.09 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  40.54 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0812  peptide ABC transporter ATPase  37.75 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  37.99 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  36.76 
 
 
653 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  37.85 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  36.36 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  38.2 
 
 
668 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  37.44 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0815  ABC transporter related protein  39.71 
 
 
246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.72 
 
 
642 aa  125  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  39.56 
 
 
234 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
237 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 
646 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  38.07 
 
 
250 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 
219 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  34.92 
 
 
642 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  37.78 
 
 
234 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  38.04 
 
 
408 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
240 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  35.26 
 
 
233 aa  123  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  37.78 
 
 
234 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  40.23 
 
 
242 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
238 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  41.76 
 
 
229 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  37.69 
 
 
221 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 
228 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  36.56 
 
 
230 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  33.33 
 
 
249 aa  122  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  39.66 
 
 
233 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  35.26 
 
 
647 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  33.02 
 
 
232 aa  121  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.54 
 
 
246 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  33.33 
 
 
241 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
233 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  33.16 
 
 
648 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  36.31 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  33.16 
 
 
648 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  40.91 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  37.23 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  37.7 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  37.64 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  40.22 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  35.23 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21600  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.56 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  35.26 
 
 
667 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  37.08 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1388  ABC transporter-related protein  34.36 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1795  ABC transporter related protein  40.11 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  34.62 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  39.44 
 
 
650 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  35.26 
 
 
667 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  36.11 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  32.96 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  39.23 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  37.63 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  36.9 
 
 
232 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
225 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  37.89 
 
 
217 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  36.69 
 
 
259 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  34.74 
 
 
656 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
248 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  36.6 
 
 
221 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  35.18 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  36.82 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  35.75 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17610  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.23 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00262944  normal  0.585837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  39.44 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.22 
 
 
644 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  35.79 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  36.57 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>