More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0620 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  59.17 
 
 
232 aa  274  7e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  50.46 
 
 
220 aa  217  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  48.18 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  48.18 
 
 
228 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  47.25 
 
 
225 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  46.82 
 
 
225 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  44.88 
 
 
223 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
213 aa  184  7e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1012  lipoprotein release ABC transporter ATPase  40.28 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  41.15 
 
 
221 aa  177  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
218 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  42.66 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 
223 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  40.45 
 
 
231 aa  168  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  40 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  38.81 
 
 
229 aa  161  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  39.63 
 
 
235 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
408 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  39.72 
 
 
222 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 
230 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
222 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
246 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  42.93 
 
 
662 aa  154  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
231 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 
231 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.06 
 
 
227 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  39.63 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  39.42 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  42.27 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
221 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 
229 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  40.2 
 
 
225 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 
234 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.57 
 
 
230 aa  151  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  39.9 
 
 
244 aa  151  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  37.27 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
244 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  41.09 
 
 
217 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
247 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.02 
 
 
226 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  38.29 
 
 
232 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.07 
 
 
280 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  43.32 
 
 
224 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  40.21 
 
 
233 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 
249 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  37.32 
 
 
236 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
247 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  39.9 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  40 
 
 
269 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  40.21 
 
 
228 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40 
 
 
228 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 
235 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  40.76 
 
 
715 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  37.33 
 
 
255 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  41.12 
 
 
255 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  37.86 
 
 
288 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
221 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  44.32 
 
 
244 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  41.62 
 
 
227 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 
345 aa  148  6e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  42.11 
 
 
235 aa  148  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  39.9 
 
 
260 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  37.93 
 
 
235 aa  148  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
266 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  39.9 
 
 
230 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.86 
 
 
242 aa  148  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  38.57 
 
 
220 aa  148  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.33 
 
 
263 aa  148  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.9 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  37.91 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  41.15 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  41.75 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.69 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  36.24 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  41.8 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  40.3 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  41.8 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.4 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  37.56 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  39.82 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  39.41 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  41.46 
 
 
660 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  37.22 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  35 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  40.1 
 
 
255 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  40.29 
 
 
239 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.89 
 
 
647 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  39.42 
 
 
242 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 
237 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
255 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  42.93 
 
 
217 aa  145  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.35 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  40.1 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  37.38 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>