More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1141 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1012  lipoprotein release ABC transporter ATPase  62.86 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  58.17 
 
 		 218 aa  251  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  45.45 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  45 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  44.55 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  44.55 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  43.72 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  44.39 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  41.67 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  41.2 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.91 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  39.11 
 
 		 235 aa  160  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.39 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.75 
 
 		 664 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  42.16 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.35 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 648 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 648 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 648 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  41.71 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  38.97 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 648 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 648 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  41.63 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  43.07 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  41.35 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  41.59 
 
 		 253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.44 
 
 		 646 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  39.73 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.38 
 
 		 648 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  41.9 
 
 		 254 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  37.74 
 
 		 277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  38.68 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  40.48 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  40.48 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  37.96 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  37.14 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  40.67 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.37 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  40.38 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  37.75 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  35.59 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  36.61 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  39.17 
 
 		 279 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  38.71 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  36.36 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 279 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39.42 
 
 		 263 aa  142  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.89 
 
 		 648 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  38.81 
 
 		 277 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  39.15 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  40.1 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  37.26 
 
 		 715 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  42.08 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  40 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  37.32 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  36.15 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  39.53 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  39.5 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.85 
 
 		 264 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.5 
 
 		 648 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  41.31 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5450  ABC transporter related  38.39 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990836  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  40.1 
 
 		 662 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  37.98 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  38.14 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  40.38 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  40.51 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  37 
 
 		 646 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  38.94 
 
 		 597 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>