More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0684 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 
218 aa  241  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  52.86 
 
 
218 aa  237  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 
213 aa  227  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1012  lipoprotein release ABC transporter ATPase  48.74 
 
 
211 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  49.53 
 
 
225 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  48.58 
 
 
228 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  48.58 
 
 
225 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  48.37 
 
 
221 aa  191  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 
228 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  42.11 
 
 
232 aa  181  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  42.93 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  41.63 
 
 
220 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  40.19 
 
 
220 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
235 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  37.5 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.71 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  40.67 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  44.1 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  41.35 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.27 
 
 
228 aa  136  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  38.16 
 
 
255 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.02 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  42.13 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  38.21 
 
 
232 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  35.68 
 
 
233 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  40.91 
 
 
903 aa  135  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  42.93 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  41.47 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  38.25 
 
 
234 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  38.28 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  40.55 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  36.53 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  36.49 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
253 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  40.48 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  38.18 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  38.71 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  39.15 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  33.48 
 
 
293 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 
233 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 
233 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
233 aa  132  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  36.94 
 
 
235 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.75 
 
 
225 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.65 
 
 
642 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  38.74 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  38.89 
 
 
229 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  39.09 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  36.87 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  35.96 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  40.47 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  38 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  37.14 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.06 
 
 
888 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  36.67 
 
 
234 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  36.05 
 
 
604 aa  129  3e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  39.71 
 
 
225 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  37.14 
 
 
248 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
240 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  37.67 
 
 
230 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  37.78 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 
244 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.91 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.9 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  36.04 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  39.15 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.09 
 
 
642 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  38.25 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  36.92 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  34.16 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  40.1 
 
 
950 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  38.91 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  39.91 
 
 
1130 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.61 
 
 
652 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  39.63 
 
 
238 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 
216 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>