More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1624 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  64.25 
 
 		 221 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  47.71 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  46.79 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  47.25 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  46.33 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  44.88 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  45.62 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  42.99 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  40.45 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  40.09 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  39.56 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  39.91 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  41.78 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  42.22 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  41.82 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  41.23 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  45.67 
 
 		 662 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  37.5 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  40.81 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  41.33 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 643 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  37.5 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  37.78 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  41.86 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1012  lipoprotein release ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  38.01 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  43.56 
 
 		 664 aa  155  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  40 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.46 
 
 		 664 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  41.1 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  39.01 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.57 
 
 		 239 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  41.4 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  41.89 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  39.38 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.81 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  40.69 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  41.75 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  40.69 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  42.23 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  40.76 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  42.78 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  40.67 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  39.81 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  38.86 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  42.36 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  40 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  39.07 
 
 		 298 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  40.38 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.09 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  37.27 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  41.94 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  38.57 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  40.71 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.99 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  39.32 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.05 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  39.62 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  39.62 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  41.58 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  40.57 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.67 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  42.57 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  39.41 
 
 		 565 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  38.43 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  37.89 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  40.45 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40.29 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  37.44 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  38.12 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>