More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2079 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  86.24 
 
 		 218 aa  380  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  60.48 
 
 		 213 aa  261  4e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1012  lipoprotein release ABC transporter ATPase  54.55 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  50.69 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  49.31 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  48.85 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  48.39 
 
 		 225 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  45.41 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  46.95 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  41.59 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  43.78 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  41.47 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  38.12 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 255 aa  154  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.44 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.74 
 
 		 664 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  40.65 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  40.18 
 
 		 664 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  38.76 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  43 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.82 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  39.19 
 
 		 660 aa  148  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  38.05 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.54 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  39.19 
 
 		 235 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  42.4 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.8 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  41.94 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.58 
 
 		 888 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  37.98 
 
 		 258 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  40.62 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  38.29 
 
 		 662 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.81 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  38.57 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.83 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  34.98 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  39.29 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  35.75 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.13 
 
 		 642 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  40.95 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  39.35 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  38.91 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  38.76 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  38.64 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 277 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.71 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  36.11 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.28 
 
 		 251 aa  141  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  35 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  36.2 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  37.93 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  37.84 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  34.1 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  37.5 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  34.1 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  34.1 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  39.09 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  39.2 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  38.46 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  38.76 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  37.78 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  36.74 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  38.18 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 291 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  39.63 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  36.36 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  35.81 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  39.37 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40 
 
 		 642 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  38.92 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  35.59 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  39.13 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  36.87 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>