More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0941 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  52.31 
 
 
232 aa  237  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  55.09 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  50.46 
 
 
220 aa  217  8.999999999999998e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  54.17 
 
 
225 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  54.63 
 
 
228 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  52.78 
 
 
225 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
218 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  43.78 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  44.55 
 
 
221 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  42.99 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
223 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1012  lipoprotein release ABC transporter ATPase  37.61 
 
 
211 aa  162  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  37.9 
 
 
235 aa  157  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  36.99 
 
 
235 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  47.57 
 
 
903 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  40 
 
 
269 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.94 
 
 
226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  38.64 
 
 
220 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.75 
 
 
240 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  42 
 
 
217 aa  148  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  37.62 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  40.1 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  43.75 
 
 
885 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.75 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  38.58 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  40.49 
 
 
660 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  39.81 
 
 
236 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  36.82 
 
 
247 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  42.23 
 
 
779 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  40.31 
 
 
662 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
243 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
230 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
643 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  36.57 
 
 
230 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  40.31 
 
 
275 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  35.71 
 
 
235 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.45 
 
 
251 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  38.14 
 
 
237 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1505  ABC transporter related  35.45 
 
 
234 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.498332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  37.27 
 
 
219 aa  141  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
248 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  37.96 
 
 
228 aa  141  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
240 aa  141  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07870  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.87 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.995675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  36.65 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  39.79 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  37.56 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  37.16 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  38.46 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  38 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  38.01 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  40.43 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.98 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  39.81 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  38.07 
 
 
256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.81 
 
 
888 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  35.91 
 
 
236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  34.42 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  39.17 
 
 
226 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.11 
 
 
280 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  35.94 
 
 
247 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
221 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  37.85 
 
 
239 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  36.28 
 
 
228 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  40.82 
 
 
234 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  33.95 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  37.27 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  37.44 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  37.26 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  40.5 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 
221 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  36.92 
 
 
238 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  37.85 
 
 
226 aa  138  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  38.5 
 
 
235 aa  138  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  39.07 
 
 
255 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  39.69 
 
 
228 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.93 
 
 
950 aa  138  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  40.82 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  40.62 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
228 aa  137  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  38.24 
 
 
239 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  38.42 
 
 
236 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
244 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 
235 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  35.75 
 
 
225 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  37.96 
 
 
228 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
248 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  40 
 
 
235 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  34.62 
 
 
234 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  40.39 
 
 
241 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  38.14 
 
 
228 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
234 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  40.69 
 
 
318 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  36.82 
 
 
229 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>