More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1977 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1624  ABC transporter related  64.25 
 
 		 223 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2559  ABC transporter domain protein  51.6 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360052 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5457  ABC transporter related  51.6 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.980494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2757  ABC transporter  51.6 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2420  ABC transporter related  50.68 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00287476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0799  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0684  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.332367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0614  ABC transporter, ATP-binding protein Vexp2  47.2 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.95 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0439  peptide ABC transporter ATPase  42.16 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  44.55 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  41.15 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.29 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  42.15 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  38.39 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  43.81 
 
 		 662 aa  174  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.27 
 
 		 664 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  41.96 
 
 		 779 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  42.73 
 
 		 664 aa  172  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 643 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  41.59 
 
 		 660 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  39.73 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  44.44 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  40.99 
 
 		 246 aa  168  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  39.62 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  40.62 
 
 		 779 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  40.18 
 
 		 1130 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  40.62 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  40.91 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  40.18 
 
 		 903 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  42.79 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  39.82 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  41.78 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  38.39 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  40.09 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  39.11 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.41 
 
 		 888 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  40.18 
 
 		 885 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  40 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  40.09 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  38.91 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  40.18 
 
 		 950 aa  161  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0080  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  37.95 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  38.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  38.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  37.95 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  37.56 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  35.91 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  39.56 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 388 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  41.82 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.57 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  42.64 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  39.46 
 
 		 241 aa  158  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  37.05 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40.81 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  40.18 
 
 		 1090 aa  158  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.7 
 
 		 642 aa  158  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.64 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  38.57 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>