More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2628 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2628  ABC transporter related protein  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0812  peptide ABC transporter ATPase  75 
 
 		 209 aa  298  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0952  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.84 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1388  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0270  peptide ABC transporter ATPase  40.19 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2165  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.213816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1115  ABC transporter related  40.19 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1093  ABC transporter related  40.19 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000270909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  40.19 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  37.19 
 
 		 641 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  37.19 
 
 		 641 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  42.93 
 
 		 648 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  38.19 
 
 		 641 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  37.73 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.07 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0277  peptide ABC transporter ATPase  38.97 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  37.79 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  37.79 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  37.56 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.31 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3794  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  44.5 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 646 aa  151  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 408 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  39.9 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.15 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  39.91 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  40.39 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.65 
 
 		 663 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  38.21 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  37.61 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  39.41 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  44.13 
 
 		 663 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  38.91 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  42.93 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  43.37 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  39.89 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  37.79 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  37.16 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  37.56 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  41.88 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  35.65 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.33 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  43.17 
 
 		 236 aa  147  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  35.65 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  42.25 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  41.75 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.81 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  39.17 
 
 		 656 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  44.67 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  40.27 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  41.62 
 
 		 654 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  40.2 
 
 		 654 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  40.5 
 
 		 647 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.25 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 654 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  35 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  42.63 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 643 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  42.64 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  42.63 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  39.34 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.1 
 
 		 648 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  41.45 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  41.35 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  38 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  37.44 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  40 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  42.46 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  39.73 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39.38 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  39.41 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  40.59 
 
 		 657 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  41.58 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.05 
 
 		 241 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  39.5 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  43.14 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  37 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.56 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  39.9 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.78 
 
 		 648 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>