More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2165 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2233  ABC transporter related  68.69 
 
 		 579 aa  777    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  59.96 
 
 		 585 aa  731    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2165  ABC transporter related  100 
 
 		 581 aa  1174    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  67.7 
 
 		 584 aa  795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  32.53 
 
 		 606 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.89 
 
 		 601 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.93 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.39 
 
 		 592 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.53 
 
 		 641 aa  279  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  32.39 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.87 
 
 		 575 aa  274  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  32.39 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  31.27 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  32.06 
 
 		 578 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.7 
 
 		 587 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  35.33 
 
 		 642 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  31.52 
 
 		 589 aa  270  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 581 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  29.07 
 
 		 623 aa  266  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  32.45 
 
 		 594 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.91 
 
 		 578 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  29.73 
 
 		 591 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  30.68 
 
 		 607 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  32.14 
 
 		 592 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  31.97 
 
 		 611 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  28.47 
 
 		 626 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  32.33 
 
 		 577 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.77 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  29.93 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.65 
 
 		 594 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  29.75 
 
 		 589 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  29.94 
 
 		 583 aa  260  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  29.75 
 
 		 611 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.21 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  28.47 
 
 		 628 aa  256  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  29.52 
 
 		 622 aa  256  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.81 
 
 		 587 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.89 
 
 		 637 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.17 
 
 		 597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  30.76 
 
 		 580 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.99 
 
 		 597 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.69 
 
 		 637 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  29.15 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.15 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.5 
 
 		 620 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.15 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.98 
 
 		 587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  29.15 
 
 		 587 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.26 
 
 		 608 aa  253  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  29.98 
 
 		 663 aa  253  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.98 
 
 		 587 aa  253  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 733 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.46 
 
 		 575 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  29.63 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.6 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.47 
 
 		 587 aa  252  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.98 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  30.84 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  31.25 
 
 		 575 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.4 
 
 		 636 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  27.84 
 
 		 581 aa  250  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  31.01 
 
 		 577 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 582 aa  249  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.43 
 
 		 586 aa  249  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.88 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.18 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.98 
 
 		 586 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.98 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.64 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  27.81 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.18 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  30.93 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.14 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  30.05 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  27.56 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  32.55 
 
 		 610 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  29.45 
 
 		 583 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 586 aa  246  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  28.36 
 
 		 592 aa  246  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  27.21 
 
 		 625 aa  246  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  27.74 
 
 		 569 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  31.63 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  29.33 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  27.75 
 
 		 631 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  29.93 
 
 		 567 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 		 586 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.93 
 
 		 567 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  27.87 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 		 586 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  29.82 
 
 		 579 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  27.58 
 
 		 627 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  29.28 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.45 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  28.75 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.32 
 
 		 586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.82 
 
 		 571 aa  244  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  28.5 
 
 		 582 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  30.71 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  28.22 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>