More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1094 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2233  ABC transporter related  69.55 
 
 		 579 aa  791    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  100 
 
 		 584 aa  1167    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2165  ABC transporter related  67.7 
 
 		 581 aa  807    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  60.82 
 
 		 585 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.85 
 
 		 606 aa  300  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  34.13 
 
 		 601 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  32.81 
 
 		 578 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  32.84 
 
 		 583 aa  293  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  32.63 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.76 
 
 		 592 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.69 
 
 		 641 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  31.8 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  31.45 
 
 		 577 aa  280  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  31.21 
 
 		 578 aa  279  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  35.08 
 
 		 642 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.41 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  30.76 
 
 		 589 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  31.94 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  28.95 
 
 		 577 aa  270  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.13 
 
 		 575 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  29.86 
 
 		 591 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  28.38 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  28.14 
 
 		 626 aa  267  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.25 
 
 		 594 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  30.47 
 
 		 733 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.45 
 
 		 588 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  28.93 
 
 		 622 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  30.39 
 
 		 581 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  30.07 
 
 		 631 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.65 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  29.41 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.79 
 
 		 573 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.34 
 
 		 580 aa  259  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  30.39 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  28.77 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.56 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.93 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.38 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  29.07 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  28.79 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  30.81 
 
 		 577 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  27.32 
 
 		 628 aa  258  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  29.02 
 
 		 581 aa  257  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  28.36 
 
 		 624 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  29.06 
 
 		 569 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.5 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  28.5 
 
 		 583 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.44 
 
 		 637 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  31.1 
 
 		 592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  32.63 
 
 		 594 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  29 
 
 		 663 aa  253  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.66 
 
 		 581 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.85 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.5 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.85 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.85 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.85 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.85 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.9 
 
 		 589 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.53 
 
 		 637 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  29.51 
 
 		 584 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  28.37 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.94 
 
 		 587 aa  251  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.26 
 
 		 608 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  27.1 
 
 		 636 aa  251  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  28.72 
 
 		 598 aa  250  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  27.41 
 
 		 627 aa  250  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.55 
 
 		 587 aa  249  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 586 aa  249  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  28.03 
 
 		 607 aa  249  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27 
 
 		 588 aa  249  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  30.18 
 
 		 577 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  29.38 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  29.73 
 
 		 578 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.73 
 
 		 617 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  29.82 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.39 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  28.45 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.42 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  28.16 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  29.54 
 
 		 675 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.76 
 
 		 593 aa  247  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 		 604 aa  247  4.9999999999999997e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  27.71 
 
 		 623 aa  247  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  28.92 
 
 		 586 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  29.06 
 
 		 579 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.01 
 
 		 587 aa  246  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 663 aa  246  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  28 
 
 		 596 aa  246  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.22 
 
 		 586 aa  246  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.02 
 
 		 586 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.35 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.67 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.42 
 
 		 575 aa  246  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.07 
 
 		 597 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  30.7 
 
 		 622 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  28.32 
 
 		 636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>