More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1339 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  100 
 
 
572 aa  1156    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  54.51 
 
 
568 aa  555  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  34.99 
 
 
571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  34.99 
 
 
571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1052  ABC transporter related  79.55 
 
 
220 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.22 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.87 
 
 
586 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.74 
 
 
618 aa  317  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.57 
 
 
586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.74 
 
 
580 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.7 
 
 
586 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  34.04 
 
 
572 aa  312  9e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1507  ABC transporter related  34.04 
 
 
572 aa  312  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.112704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1465  ABC transporter related  36.71 
 
 
564 aa  312  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.04 
 
 
586 aa  312  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.04 
 
 
586 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.04 
 
 
586 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1506  ABC transporter related  36.71 
 
 
564 aa  312  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00391095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.87 
 
 
586 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.87 
 
 
586 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.56 
 
 
602 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.85 
 
 
583 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 
578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.7 
 
 
578 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.7 
 
 
578 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.86 
 
 
591 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.06 
 
 
586 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
586 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  32.98 
 
 
566 aa  298  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.4 
 
 
581 aa  297  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
566 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.43 
 
 
575 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.29 
 
 
575 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.51 
 
 
597 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.55 
 
 
556 aa  293  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.24 
 
 
600 aa  292  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.19 
 
 
582 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  33.45 
 
 
590 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.59 
 
 
586 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  32.29 
 
 
588 aa  286  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 
586 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33.9 
 
 
612 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.84 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.03 
 
 
584 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.6 
 
 
590 aa  283  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  32.65 
 
 
586 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 
586 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
586 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
586 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.97 
 
 
586 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  30.05 
 
 
614 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  31.65 
 
 
594 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.97 
 
 
586 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
581 aa  279  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  32.71 
 
 
601 aa  279  9e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.7 
 
 
584 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  30.82 
 
 
760 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  31.18 
 
 
601 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  31.72 
 
 
584 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  30.02 
 
 
764 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.97 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  32.36 
 
 
578 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  31.09 
 
 
773 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  29.69 
 
 
608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  30.72 
 
 
606 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  34.33 
 
 
608 aa  273  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
623 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  33.53 
 
 
651 aa  272  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  34.48 
 
 
593 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  31.74 
 
 
609 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.93 
 
 
572 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.99 
 
 
617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  35.23 
 
 
727 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  32.88 
 
 
577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  31.12 
 
 
597 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 
571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  33.89 
 
 
610 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.39 
 
 
573 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.68 
 
 
586 aa  269  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  29.31 
 
 
611 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  28.57 
 
 
579 aa  269  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  29.26 
 
 
770 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.4 
 
 
587 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.94 
 
 
589 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  29.43 
 
 
750 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  26.68 
 
 
628 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  33.04 
 
 
588 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  29.84 
 
 
635 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  29.51 
 
 
592 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.24 
 
 
571 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  31.45 
 
 
592 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  29.03 
 
 
625 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  31.46 
 
 
610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.09 
 
 
592 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  30.59 
 
 
607 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  28.6 
 
 
764 aa  267  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  29.3 
 
 
603 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.56 
 
 
614 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  30.49 
 
 
784 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>