More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0215 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0215  ABC transporter related  100 
 
 		 530 aa  1050    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  26.28 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.56 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 		 529 aa  160  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.19 
 
 		 577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.11 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.35 
 
 		 563 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  25.18 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  29.06 
 
 		 526 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  23.67 
 
 		 588 aa  133  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  23.66 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  24.17 
 
 		 604 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.79 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  27.29 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.69 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  24.84 
 
 		 741 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  27.49 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.95 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.21 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  23.59 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  24.41 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  24.35 
 
 		 671 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  25.36 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  25.85 
 
 		 742 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  25.05 
 
 		 583 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.87 
 
 		 582 aa  123  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.35 
 
 		 583 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  24.11 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  25.99 
 
 		 721 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  29.25 
 
 		 738 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  34.74 
 
 		 591 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  23.54 
 
 		 705 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.89 
 
 		 625 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  24.85 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 		 574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  24.24 
 
 		 607 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.91 
 
 		 574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1694  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.31 
 
 		 529 aa  120  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0047408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  22.9 
 
 		 610 aa  120  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.24 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  26.21 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.2 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  30.69 
 
 		 695 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.78 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  26.8 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  29.05 
 
 		 720 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  26.8 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  26.51 
 
 		 608 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.75 
 
 		 586 aa  117  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.4 
 
 		 513 aa  117  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02608  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.98 
 
 		 574 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2769  ABC transporter related  29.8 
 
 		 618 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.79 
 
 		 589 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  23.06 
 
 		 587 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.09 
 
 		 528 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003746  transport ATP-binding protein CydC  31.76 
 
 		 573 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  24.19 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  23.81 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  24.01 
 
 		 608 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.73 
 
 		 596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.76 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.02 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1635  ABC transporter related  27.18 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  25.44 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  24.63 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  29.89 
 
 		 737 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  26.04 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  25.95 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  27.72 
 
 		 592 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0580  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.43 
 
 		 571 aa  115  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  24.7 
 
 		 610 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.85 
 
 		 590 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0508  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  22.89 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  24.12 
 
 		 782 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1150  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.01 
 
 		 576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.91348  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  26.5 
 
 		 870 aa  114  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  25.53 
 
 		 600 aa  114  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  24.14 
 
 		 574 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  25.84 
 
 		 577 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  23.17 
 
 		 613 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.49 
 
 		 574 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 566 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  24.54 
 
 		 613 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  22.91 
 
 		 577 aa  113  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.49 
 
 		 574 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.51 
 
 		 579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3474  ABC transporter related  30.4 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  25.23 
 
 		 572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0801  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  24.78 
 
 		 573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  36.45 
 
 		 747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  24.49 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0352  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.5 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.12 
 
 		 583 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1007  ABC transporter related  24.67 
 
 		 784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  30.37 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>