More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0921 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0921  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
579 aa  1180    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.451099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  35.94 
 
 
677 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 
666 aa  330  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 
579 aa  324  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.77 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 
666 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.63 
 
 
587 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.24 
 
 
666 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 
666 aa  316  9e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.24 
 
 
666 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  32.99 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.99 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.99 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.05 
 
 
666 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1105  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.45 
 
 
587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.24 
 
 
666 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 
666 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.02 
 
 
587 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.02 
 
 
587 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  35.91 
 
 
666 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.45 
 
 
587 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  32.81 
 
 
594 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  33.46 
 
 
592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.72 
 
 
597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  33.33 
 
 
587 aa  300  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 
604 aa  298  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  34.5 
 
 
685 aa  296  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  31.4 
 
 
600 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  33.22 
 
 
602 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  32.83 
 
 
603 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  33.84 
 
 
602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.06 
 
 
597 aa  288  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.64 
 
 
631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  32.51 
 
 
613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.04 
 
 
588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  32.69 
 
 
606 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  32.94 
 
 
621 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.08 
 
 
597 aa  281  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.08 
 
 
597 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  32.31 
 
 
589 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  30.95 
 
 
617 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  33.71 
 
 
606 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.76 
 
 
599 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  29.73 
 
 
607 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  31.09 
 
 
594 aa  277  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.6 
 
 
592 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.15 
 
 
590 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  30.51 
 
 
634 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
618 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  29.67 
 
 
625 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.65 
 
 
594 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.94 
 
 
587 aa  273  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.74 
 
 
600 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.12 
 
 
586 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.35 
 
 
589 aa  272  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.39 
 
 
584 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  31.4 
 
 
608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  33.28 
 
 
578 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.06 
 
 
640 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.26 
 
 
594 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  32.49 
 
 
614 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  33.68 
 
 
598 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.44 
 
 
578 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.44 
 
 
578 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  30.77 
 
 
600 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.28 
 
 
598 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  32.18 
 
 
592 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  31.24 
 
 
598 aa  266  8e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.1 
 
 
602 aa  266  8e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
598 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  32.16 
 
 
671 aa  266  8.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  30.7 
 
 
617 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  31.94 
 
 
615 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.97 
 
 
608 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  32.58 
 
 
622 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  29.9 
 
 
631 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  30.03 
 
 
637 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  29.9 
 
 
631 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  29.71 
 
 
631 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  29.9 
 
 
669 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.2 
 
 
591 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.88 
 
 
594 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  29.2 
 
 
663 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  30.02 
 
 
592 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  30.69 
 
 
588 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  30.64 
 
 
811 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  30.36 
 
 
642 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.92 
 
 
597 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  29.76 
 
 
672 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  30.21 
 
 
582 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  31.54 
 
 
588 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3148  ABC transporter related protein  29.19 
 
 
632 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  31.86 
 
 
592 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  32.13 
 
 
630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  30.17 
 
 
585 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2277  ABC transporter related  33.47 
 
 
598 aa  260  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  28.91 
 
 
652 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>