More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2277 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2277  ABC transporter related  100 
 
 		 598 aa  1215    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  39.16 
 
 		 617 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.34 
 
 		 598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  38.18 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.66 
 
 		 598 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.17 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.66 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 620 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  39.03 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.03 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.03 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.2 
 
 		 598 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.07 
 
 		 608 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.03 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  38.85 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.15 
 
 		 614 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  39.66 
 
 		 598 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  38.05 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  38.05 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  40.27 
 
 		 615 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  37.52 
 
 		 631 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  39.04 
 
 		 640 aa  379  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.82 
 
 		 625 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  35.67 
 
 		 613 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  36.65 
 
 		 582 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  35.95 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  40.43 
 
 		 625 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 618 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 600 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  40.74 
 
 		 671 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2246  ABC transporter related  34.34 
 
 		 650 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  34.25 
 
 		 584 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  42.09 
 
 		 634 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.9 
 
 		 618 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.9 
 
 		 618 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.5 
 
 		 597 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.6 
 
 		 677 aa  362  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 		 632 aa  360  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.13 
 
 		 602 aa  359  6e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  40.92 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.34 
 
 		 635 aa  357  3.9999999999999996e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.6 
 
 		 592 aa  357  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.98 
 
 		 595 aa  356  6.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.4 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  35.22 
 
 		 629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  36.07 
 
 		 631 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  40.08 
 
 		 620 aa  353  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  35.21 
 
 		 669 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  34.51 
 
 		 646 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  35.57 
 
 		 607 aa  351  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 591 aa  349  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  36.68 
 
 		 628 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.81 
 
 		 691 aa  347  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  37.2 
 
 		 593 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.52 
 
 		 617 aa  347  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.16 
 
 		 597 aa  346  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.08 
 
 		 615 aa  346  6e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  35.93 
 
 		 625 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  34.09 
 
 		 619 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  35.01 
 
 		 614 aa  345  2e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.46 
 
 		 601 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  39.6 
 
 		 631 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  39.6 
 
 		 631 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  35.6 
 
 		 624 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  35.09 
 
 		 640 aa  343  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 811 aa  343  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 663 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  38.75 
 
 		 666 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.88 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  36.02 
 
 		 652 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf684  ABC-type multidrug transport system  38.26 
 
 		 617 aa  342  2e-92  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.47 
 
 		 594 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 630 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  39.21 
 
 		 631 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.3 
 
 		 670 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  34.99 
 
 		 626 aa  339  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  36.9 
 
 		 593 aa  339  8e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 		 598 aa  339  9.999999999999999e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  35.91 
 
 		 613 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  37.67 
 
 		 663 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  38.92 
 
 		 672 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  35.49 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.41 
 
 		 608 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  34.05 
 
 		 614 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 		 593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 594 aa  337  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 631 aa  336  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  40.64 
 
 		 642 aa  336  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 598 aa  336  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.49 
 
 		 637 aa  336  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  33.33 
 
 		 765 aa  336  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  33.33 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.69 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  35.94 
 
 		 623 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  34.61 
 
 		 653 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  35.47 
 
 		 600 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  38.84 
 
 		 649 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>