More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1937 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.29 
 
 
604 aa  677    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
599 aa  1228    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.03 
 
 
597 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  45.95 
 
 
594 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  44.92 
 
 
594 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  42.93 
 
 
587 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  42.41 
 
 
587 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  42.41 
 
 
587 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.86 
 
 
581 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  41.71 
 
 
587 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 
587 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 
587 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.71 
 
 
587 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.71 
 
 
587 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
592 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.01 
 
 
587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.01 
 
 
587 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  41.87 
 
 
587 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.73 
 
 
579 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  43.86 
 
 
606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  42.46 
 
 
677 aa  412  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  43.15 
 
 
600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
594 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.2 
 
 
666 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.36 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  39.76 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  39.8 
 
 
666 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.76 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.41 
 
 
589 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.96 
 
 
666 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  36.89 
 
 
588 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 
666 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  39.56 
 
 
666 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39 
 
 
592 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.49 
 
 
600 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
586 aa  356  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.09 
 
 
597 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.72 
 
 
614 aa  355  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.5 
 
 
590 aa  353  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.92 
 
 
591 aa  353  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  36.95 
 
 
588 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.36 
 
 
614 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  37.52 
 
 
611 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 
622 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.32 
 
 
609 aa  343  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.47 
 
 
635 aa  342  9e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.6 
 
 
608 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  35.3 
 
 
602 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.39 
 
 
613 aa  339  8e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  37.07 
 
 
610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  36.42 
 
 
685 aa  336  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  38.3 
 
 
597 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  38.3 
 
 
597 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.52 
 
 
650 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.57 
 
 
611 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.7 
 
 
617 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  37.12 
 
 
645 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.91 
 
 
607 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
598 aa  333  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  36.38 
 
 
585 aa  332  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.18 
 
 
637 aa  331  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.25 
 
 
592 aa  329  8e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.79 
 
 
592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  34.09 
 
 
579 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 
608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.77 
 
 
611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  33.84 
 
 
625 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  35.56 
 
 
616 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  34.09 
 
 
579 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.67 
 
 
617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  32.98 
 
 
592 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  34.97 
 
 
592 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
620 aa  326  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  34.31 
 
 
625 aa  324  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  36.07 
 
 
634 aa  324  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  36.38 
 
 
669 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.41 
 
 
587 aa  323  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.75 
 
 
597 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
636 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  35.96 
 
 
591 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  36.38 
 
 
663 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
733 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  32.13 
 
 
599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.44 
 
 
702 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
600 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  36.27 
 
 
631 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  36.27 
 
 
631 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  36.27 
 
 
631 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  35.67 
 
 
606 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  31.33 
 
 
578 aa  317  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
637 aa  317  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 
602 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.07 
 
 
589 aa  317  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  31.95 
 
 
603 aa  316  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  32.19 
 
 
618 aa  316  9e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 
637 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.52 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>