More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1391 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  100 
 
 		 594 aa  1213    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.69 
 
 		 597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  46.66 
 
 		 594 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.83 
 
 		 604 aa  530  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.92 
 
 		 599 aa  524  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  44.23 
 
 		 587 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  43.89 
 
 		 587 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 592 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 587 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.28 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  43.28 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.28 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.76 
 
 		 587 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 587 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.93 
 
 		 587 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  42.69 
 
 		 587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.49 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.07 
 
 		 579 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  41.04 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.71 
 
 		 600 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  39.45 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.96 
 
 		 666 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.15 
 
 		 666 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  41.54 
 
 		 666 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.15 
 
 		 666 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.15 
 
 		 666 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.15 
 
 		 666 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.77 
 
 		 666 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.15 
 
 		 666 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  36.47 
 
 		 588 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  40.58 
 
 		 666 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.56 
 
 		 597 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  34.6 
 
 		 589 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  33.68 
 
 		 592 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 600 aa  349  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 586 aa  347  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.07 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 589 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 607 aa  339  8e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.85 
 
 		 588 aa  339  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.96 
 
 		 591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  33.22 
 
 		 585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  31.73 
 
 		 602 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.08 
 
 		 592 aa  336  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  36.49 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 685 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.57 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.1 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.05 
 
 		 597 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.05 
 
 		 597 aa  330  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  30.36 
 
 		 672 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  34.15 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.47 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  32.89 
 
 		 619 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.32 
 
 		 590 aa  326  9e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 811 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  31.67 
 
 		 614 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.28 
 
 		 609 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  31.74 
 
 		 608 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  32.94 
 
 		 636 aa  323  6e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  32.71 
 
 		 665 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.09 
 
 		 606 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  32.18 
 
 		 623 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  36.12 
 
 		 631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  32.3 
 
 		 584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.02 
 
 		 702 aa  320  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.25 
 
 		 637 aa  320  5e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  33.28 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  32.32 
 
 		 611 aa  319  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.32 
 
 		 592 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.83 
 
 		 617 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  31.29 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.52 
 
 		 614 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  35.25 
 
 		 645 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  32.71 
 
 		 587 aa  317  5e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  31.82 
 
 		 622 aa  316  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  31.5 
 
 		 611 aa  317  6e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.31 
 
 		 594 aa  316  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.51 
 
 		 620 aa  316  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  34.02 
 
 		 672 aa  316  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  31.47 
 
 		 635 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  31.96 
 
 		 602 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  33.08 
 
 		 663 aa  316  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.59 
 
 		 592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.08 
 
 		 637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 600 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.18 
 
 		 598 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  32.63 
 
 		 609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  33.21 
 
 		 666 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  31.94 
 
 		 663 aa  313  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.94 
 
 		 669 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.51 
 
 		 598 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  31.9 
 
 		 603 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.66 
 
 		 670 aa  313  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.05 
 
 		 598 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.2 
 
 		 593 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 598 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>