More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0812 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 537 aa  1083    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30.92 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  25.51 
 
 		 577 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.73 
 
 		 577 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  24.43 
 
 		 563 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.29 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.83 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  26.52 
 
 		 572 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  25.15 
 
 		 581 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.13 
 
 		 596 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  24.2 
 
 		 546 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  23.89 
 
 		 599 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  23.96 
 
 		 526 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  23.21 
 
 		 588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.73 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  26.74 
 
 		 580 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.95 
 
 		 586 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.17 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0215  ABC transporter related  22.79 
 
 		 530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.95 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.95 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.17 
 
 		 586 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  25.95 
 
 		 586 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.95 
 
 		 586 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.95 
 
 		 586 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  26.11 
 
 		 559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.65 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  26.4 
 
 		 584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  25.28 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.12 
 
 		 584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  23.43 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  25.62 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  26.68 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  25.21 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  25.94 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0801  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.35 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.89 
 
 		 562 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.4 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  24.24 
 
 		 685 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  23.71 
 
 		 588 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  24.95 
 
 		 612 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13640  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  35.29 
 
 		 574 aa  124  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.53 
 
 		 526 aa  124  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3192  ABC transporter related  24.47 
 
 		 701 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678636  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  22.87 
 
 		 572 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  23.48 
 
 		 597 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  24.95 
 
 		 596 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  23.48 
 
 		 597 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  23.43 
 
 		 608 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  25.99 
 
 		 574 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.02 
 
 		 562 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.09 
 
 		 738 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.61 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.77 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  24.64 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2288  ABC transporter related  25.14 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418994  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  24.04 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1293  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  24.95 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.408226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.17 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  26.34 
 
 		 584 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.18 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  25.52 
 
 		 734 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  27.27 
 
 		 602 aa  121  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  24.95 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.89 
 
 		 581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.06 
 
 		 581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  24.71 
 
 		 582 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  23.68 
 
 		 611 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  30.48 
 
 		 762 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.81 
 
 		 694 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  23.29 
 
 		 601 aa  120  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.24 
 
 		 573 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  29.91 
 
 		 591 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.25 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  28.95 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  25.45 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  36.96 
 
 		 573 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  26.65 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  23.37 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  24.1 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  25.31 
 
 		 734 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  26.02 
 
 		 721 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  23.12 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  28.09 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0881  ABC transporter related  26.53 
 
 		 607 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.435761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  28.09 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  25.32 
 
 		 577 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.17 
 
 		 576 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  24.64 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  25.21 
 
 		 577 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  22.57 
 
 		 571 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  23.53 
 
 		 566 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.25 
 
 		 587 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  25.04 
 
 		 577 aa  117  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  24.61 
 
 		 716 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.53 
 
 		 525 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  24.58 
 
 		 604 aa  117  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  23.69 
 
 		 572 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  24.84 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  27.93 
 
 		 715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>