More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0881 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0881  ABC transporter related  100 
 
 
607 aa  1225    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.435761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  35.68 
 
 
626 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2545  ABC transporter related  34.88 
 
 
626 aa  327  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 
610 aa  316  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  35.92 
 
 
624 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  34.57 
 
 
609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  35.29 
 
 
609 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  35.91 
 
 
621 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.57 
 
 
615 aa  301  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  35.48 
 
 
611 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  33.98 
 
 
609 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31 
 
 
610 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  34.72 
 
 
622 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  35.54 
 
 
609 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  31.63 
 
 
614 aa  297  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  31.4 
 
 
610 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.3 
 
 
625 aa  296  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  31.19 
 
 
609 aa  296  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  33.8 
 
 
609 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  31.19 
 
 
610 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  34.07 
 
 
621 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  34.78 
 
 
612 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  31.3 
 
 
610 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  33.98 
 
 
609 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  32.73 
 
 
616 aa  293  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  32.87 
 
 
621 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.94 
 
 
609 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  33.14 
 
 
607 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1235  ABC transporter related  31.1 
 
 
610 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0197069  normal  0.341484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  32.73 
 
 
609 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2598  ABC transporter related  31.17 
 
 
618 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2985  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.17 
 
 
618 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  33.8 
 
 
609 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  34.13 
 
 
609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  30.53 
 
 
610 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  31.35 
 
 
616 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  35.52 
 
 
609 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.52 
 
 
614 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  30.63 
 
 
609 aa  287  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.78 
 
 
619 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  34.44 
 
 
613 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  32.68 
 
 
614 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  33.21 
 
 
627 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  30.36 
 
 
610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  32.9 
 
 
646 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  32.57 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  32.57 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  31.85 
 
 
609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  34.24 
 
 
610 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  30.05 
 
 
613 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  34.11 
 
 
613 aa  283  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0082  ABC transporter related  31.63 
 
 
614 aa  283  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  34.43 
 
 
618 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  33.76 
 
 
610 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  31.3 
 
 
637 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  33.8 
 
 
603 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  33.13 
 
 
618 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  32.74 
 
 
622 aa  281  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  34.02 
 
 
619 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  33.53 
 
 
618 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.77 
 
 
621 aa  280  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.65 
 
 
610 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.15 
 
 
617 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  30.74 
 
 
610 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  34.14 
 
 
609 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  31.35 
 
 
637 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  30.67 
 
 
611 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0011  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
608 aa  277  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.88 
 
 
619 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
609 aa  276  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  31.7 
 
 
614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34 
 
 
630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
706 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  31.13 
 
 
621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  29.54 
 
 
610 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  33 
 
 
636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  34.29 
 
 
617 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  34.63 
 
 
658 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  34.63 
 
 
617 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  31.05 
 
 
621 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.28 
 
 
612 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  31.75 
 
 
609 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  33.95 
 
 
617 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  33.11 
 
 
609 aa  269  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  33.6 
 
 
617 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 
608 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  31.41 
 
 
612 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.91 
 
 
617 aa  267  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.58 
 
 
610 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  33.54 
 
 
610 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.67 
 
 
612 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  33.75 
 
 
610 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0083  eflux ABC transporter inner membrane protein  31.04 
 
 
637 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  29.32 
 
 
630 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  30.23 
 
 
610 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  30.61 
 
 
615 aa  260  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  32.99 
 
 
618 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  32.74 
 
 
617 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  32.72 
 
 
619 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0090  ABC transporter related  29.91 
 
 
636 aa  257  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>