More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9610 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 615 aa  1247    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  40.13 
 
 		 610 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  42.78 
 
 		 609 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  40.17 
 
 		 610 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.2 
 
 		 610 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  40.2 
 
 		 610 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.48 
 
 		 610 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.65 
 
 		 610 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  40.33 
 
 		 610 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  41.13 
 
 		 622 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1674  ABC transporter related  39.53 
 
 		 610 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.41 
 
 		 610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39 
 
 		 610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  39.5 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2985  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.73 
 
 		 618 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2598  ABC transporter related  39.73 
 
 		 618 aa  445  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1235  ABC transporter related  39.21 
 
 		 610 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0197069  normal  0.341484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1307  ABC transporter related  40.2 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.556896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  39.61 
 
 		 610 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  43.33 
 
 		 610 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 		 610 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  38.42 
 
 		 622 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 		 609 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  38.7 
 
 		 612 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  40.81 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 616 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  38.03 
 
 		 618 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.96 
 
 		 619 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  37.7 
 
 		 618 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  39.6 
 
 		 624 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  38.45 
 
 		 621 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  39.46 
 
 		 621 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 609 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  39.39 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 609 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  38.38 
 
 		 609 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0113  ABC transporter related  38.3 
 
 		 619 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  37.89 
 
 		 616 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.77 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  39.23 
 
 		 637 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  37.42 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  41.83 
 
 		 609 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  40.44 
 
 		 608 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  37.09 
 
 		 609 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  38.26 
 
 		 613 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  38.33 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  40.39 
 
 		 609 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  40.64 
 
 		 609 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 706 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1493  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.8 
 
 		 621 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.246296  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  39.14 
 
 		 614 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.44 
 
 		 609 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  36.27 
 
 		 609 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  38.45 
 
 		 618 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  40.12 
 
 		 609 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.14 
 
 		 614 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  38.45 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  41.04 
 
 		 618 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.43 
 
 		 630 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  38.45 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  39.27 
 
 		 614 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  36.11 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.27 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  37.95 
 
 		 621 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.87 
 
 		 617 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  37.19 
 
 		 621 aa  399  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.63 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  36.16 
 
 		 621 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.35 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  39.2 
 
 		 613 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  36.18 
 
 		 617 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  39.07 
 
 		 617 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  35.78 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  35.95 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  35.78 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.66 
 
 		 612 aa  389  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  39.39 
 
 		 609 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0082  ABC transporter related  39.85 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  36.71 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  39.11 
 
 		 627 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.81 
 
 		 619 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  36.17 
 
 		 619 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 		 630 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  40.43 
 
 		 626 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  39.7 
 
 		 612 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1214  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.94 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  39.62 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  39.38 
 
 		 617 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  35.71 
 
 		 636 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  40.16 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  37.6 
 
 		 617 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  35.62 
 
 		 617 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  35.62 
 
 		 617 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  39.43 
 
 		 617 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  37.65 
 
 		 614 aa  362  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  38.24 
 
 		 615 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0090  ABC transporter related  34.52 
 
 		 636 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  38.9 
 
 		 617 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  38.9 
 
 		 658 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0083  eflux ABC transporter inner membrane protein  34.3 
 
 		 637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>