More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0336 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  100 
 
 		 541 aa  1098    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.49 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  31.99 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  33.03 
 
 		 572 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  29.96 
 
 		 546 aa  233  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.62 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 		 563 aa  210  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  26.98 
 
 		 588 aa  206  9e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.15 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.87 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  30.25 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.72 
 
 		 546 aa  180  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.18 
 
 		 533 aa  180  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.14 
 
 		 525 aa  179  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  26.79 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.19 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.14 
 
 		 535 aa  163  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  25.64 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.64 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.16 
 
 		 617 aa  157  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  37.13 
 
 		 712 aa  157  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  34.55 
 
 		 724 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  34.55 
 
 		 724 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  28.87 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  37.13 
 
 		 712 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  28.91 
 
 		 740 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  40.09 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3382  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  40 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000301106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  32.93 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1981  transport ATP-binding protein CydD  29.1 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.47079e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.69 
 
 		 575 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.01 
 
 		 625 aa  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  25 
 
 		 597 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  25 
 
 		 597 aa  151  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  25.61 
 
 		 638 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  28.87 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1780  transport ATP-binding protein  28.41 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  24.85 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1946  transport ATP-binding protein CydD  40.69 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  28.87 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2045  transport ATP-binding protein CydD  28.64 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  27.47 
 
 		 652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  25.61 
 
 		 620 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  24.43 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  26.24 
 
 		 595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  25.99 
 
 		 691 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  26.04 
 
 		 614 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  27.41 
 
 		 567 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  29.55 
 
 		 595 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  31.78 
 
 		 721 aa  147  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  26.8 
 
 		 606 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.44 
 
 		 573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  32.24 
 
 		 728 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  25.73 
 
 		 663 aa  146  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  24.52 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.86 
 
 		 613 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  35.51 
 
 		 762 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  32.98 
 
 		 740 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  26.87 
 
 		 594 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  28.86 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  32.68 
 
 		 588 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  28.92 
 
 		 548 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  26.96 
 
 		 584 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  27.03 
 
 		 567 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2024  transport ATP-binding protein CydD  37.44 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.605538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.85 
 
 		 600 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  25.15 
 
 		 672 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  27.23 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  31.53 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  28.61 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.05 
 
 		 571 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  26 
 
 		 568 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  28.93 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  31.53 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl118  multidrug ABC transporter  26.33 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  32.2 
 
 		 728 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  25.27 
 
 		 609 aa  144  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  26.11 
 
 		 566 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  27.9 
 
 		 589 aa  144  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.86 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.86 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.86 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.86 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.63 
 
 		 529 aa  143  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  25.57 
 
 		 680 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  24.86 
 
 		 571 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.86 
 
 		 571 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  26.49 
 
 		 610 aa  143  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  25.69 
 
 		 666 aa  143  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  28.72 
 
 		 719 aa  143  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.34 
 
 		 609 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.65 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.34 
 
 		 591 aa  143  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.61 
 
 		 578 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.87 
 
 		 670 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  25.05 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  25.36 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.86 
 
 		 571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1534  ABC transporter related  25.63 
 
 		 668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.76 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>