More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1609 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 529 aa  1073    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.17 
 
 		 544 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.19 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.65 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.65 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  23.88 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 		 588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.68 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  25.63 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  23.66 
 
 		 577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.45 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.42 
 
 		 527 aa  143  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  23.82 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.79 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  30 
 
 		 530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  27.02 
 
 		 546 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  35.09 
 
 		 595 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.4 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  30.54 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  26.98 
 
 		 578 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  29.34 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  34.21 
 
 		 595 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.18 
 
 		 617 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  28.52 
 
 		 546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  25.7 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  25.7 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.92 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.95 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  25.54 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  24.54 
 
 		 625 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.33 
 
 		 581 aa  124  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.63 
 
 		 596 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  36.02 
 
 		 601 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  27.13 
 
 		 615 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.28 
 
 		 525 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  22.16 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2288  ABC transporter related  25.61 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418994  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  30.17 
 
 		 734 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  26.41 
 
 		 596 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.53 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  27.54 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  23.6 
 
 		 597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  24.87 
 
 		 643 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  25.1 
 
 		 614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  26.75 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.02 
 
 		 598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  27.54 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.08 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2985  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.36 
 
 		 618 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2598  ABC transporter related  28.36 
 
 		 618 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  23.56 
 
 		 597 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.19 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  34.84 
 
 		 574 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  22.08 
 
 		 581 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  30.97 
 
 		 748 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  30.17 
 
 		 734 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2168  ABC transporter related  22.94 
 
 		 572 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3110  ABC transporter related protein  24.36 
 
 		 581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  33.93 
 
 		 608 aa  116  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  26.68 
 
 		 610 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 		 564 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  23.58 
 
 		 578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.64 
 
 		 633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  30.71 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  25.47 
 
 		 608 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  23.8 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.54 
 
 		 598 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.09 
 
 		 601 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  23.58 
 
 		 578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.82 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.09 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  24.01 
 
 		 582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.16 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2488  ABC transporter related  31.07 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  32.11 
 
 		 601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  29.56 
 
 		 597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  26.26 
 
 		 610 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.74 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  25.83 
 
 		 618 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  28 
 
 		 582 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  28.14 
 
 		 598 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  23.98 
 
 		 630 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  23.78 
 
 		 577 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  36.14 
 
 		 577 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.55 
 
 		 738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  26.88 
 
 		 610 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.46 
 
 		 617 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  26.17 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  34.38 
 
 		 602 aa  114  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  27.78 
 
 		 607 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.68 
 
 		 1000 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  26.95 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  25.13 
 
 		 593 aa  114  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.62 
 
 		 578 aa  114  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  26.64 
 
 		 596 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  31.67 
 
 		 737 aa  114  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.54 
 
 		 455 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  27.18 
 
 		 597 aa  114  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>