More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0885 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  100 
 
 		 590 aa  1187    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  46.75 
 
 		 588 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  47.7 
 
 		 621 aa  521  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0069  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 589 aa  525  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.590448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 		 598 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  43.77 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 597 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.66 
 
 		 596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  43.47 
 
 		 596 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.84 
 
 		 608 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  41.3 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  41.89 
 
 		 610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  41.96 
 
 		 610 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 		 610 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  41.76 
 
 		 610 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  41.4 
 
 		 593 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  40.94 
 
 		 605 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 595 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  28.26 
 
 		 597 aa  253  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.77 
 
 		 608 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  29.87 
 
 		 601 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  29.87 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.21 
 
 		 600 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.98 
 
 		 582 aa  240  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  29.3 
 
 		 602 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.16 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.38 
 
 		 575 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  30.68 
 
 		 578 aa  238  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  28.6 
 
 		 603 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  29.21 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.51 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  32.64 
 
 		 609 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.59 
 
 		 600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.05 
 
 		 586 aa  236  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  28.28 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.78 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.78 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.78 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  27.61 
 
 		 591 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.78 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  28.33 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.28 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.28 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.83 
 
 		 625 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.33 
 
 		 586 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.52 
 
 		 602 aa  233  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.07 
 
 		 587 aa  233  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.8 
 
 		 1016 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.8 
 
 		 1013 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.82 
 
 		 580 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.95 
 
 		 597 aa  232  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.95 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.81 
 
 		 582 aa  231  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.9 
 
 		 607 aa  231  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  27.54 
 
 		 599 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  30.98 
 
 		 596 aa  230  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.23 
 
 		 582 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  29.17 
 
 		 651 aa  229  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  28.4 
 
 		 601 aa  230  7e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.43 
 
 		 598 aa  229  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1819  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.98 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.372613  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.91 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  27.81 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.32 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 639 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.73 
 
 		 582 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  27.64 
 
 		 585 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  31.03 
 
 		 588 aa  227  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.5 
 
 		 586 aa  228  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.63 
 
 		 720 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  27.49 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.35 
 
 		 579 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.6 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.96 
 
 		 1012 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  29.97 
 
 		 568 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  30.24 
 
 		 611 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.87 
 
 		 586 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  28.79 
 
 		 620 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.87 
 
 		 586 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.29 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.96 
 
 		 727 aa  226  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.87 
 
 		 586 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  30.29 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  27.02 
 
 		 594 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  30.38 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>