More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0069 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0069  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 589 aa  1182    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.590448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  47 
 
 		 590 aa  525  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 598 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 610 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  43.2 
 
 		 554 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  42.34 
 
 		 621 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 		 597 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  41.77 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.08 
 
 		 596 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.47 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  40.08 
 
 		 593 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  39.06 
 
 		 605 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  39.53 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  38.48 
 
 		 608 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  38.94 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.06 
 
 		 608 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  38.55 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  27.64 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.64 
 
 		 587 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.36 
 
 		 571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.05 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.05 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  27.51 
 
 		 586 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.05 
 
 		 571 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.05 
 
 		 571 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  30.68 
 
 		 583 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.85 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  27.16 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.16 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  28.11 
 
 		 622 aa  238  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.43 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.85 
 
 		 580 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.62 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.81 
 
 		 597 aa  237  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.42 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.44 
 
 		 597 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  27.16 
 
 		 586 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  26.99 
 
 		 586 aa  236  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.99 
 
 		 586 aa  236  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.85 
 
 		 571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.18 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  29.05 
 
 		 568 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  27.24 
 
 		 601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.19 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.13 
 
 		 572 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  27.24 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.36 
 
 		 625 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30.31 
 
 		 587 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  29.8 
 
 		 596 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  33.97 
 
 		 609 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  29 
 
 		 627 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.96 
 
 		 572 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  27.18 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.18 
 
 		 609 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.79 
 
 		 587 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  28.75 
 
 		 572 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.58 
 
 		 617 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.6 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.6 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.01 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.6 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  28.11 
 
 		 620 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  28.75 
 
 		 572 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.3 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  27.3 
 
 		 593 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  28.6 
 
 		 610 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.24 
 
 		 586 aa  229  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.6 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  27.36 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  29.82 
 
 		 764 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.6 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.3 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.09 
 
 		 625 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  28.46 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  29.17 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  27.53 
 
 		 607 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  29.17 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.64 
 
 		 614 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.93 
 
 		 613 aa  228  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.41 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.98 
 
 		 768 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  26.87 
 
 		 603 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  28.54 
 
 		 602 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.39 
 
 		 583 aa  228  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 640 aa  228  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  28.34 
 
 		 584 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  28.46 
 
 		 635 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  29.24 
 
 		 596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  27.59 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  25.68 
 
 		 597 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>