More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2488 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  55.91 
 
 		 617 aa  690    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2404  ABC transporter related  58.81 
 
 		 592 aa  720    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  56.08 
 
 		 617 aa  682    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2488  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1219    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.58 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.58 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.41 
 
 		 586 aa  273  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.24 
 
 		 586 aa  270  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 		 586 aa  270  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.24 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.86 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.9 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.83 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.83 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.19 
 
 		 597 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.7 
 
 		 614 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.31 
 
 		 578 aa  259  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.62 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  29.19 
 
 		 584 aa  257  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  34.68 
 
 		 468 aa  257  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  30.74 
 
 		 777 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  28.79 
 
 		 584 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  30.32 
 
 		 572 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.5 
 
 		 586 aa  256  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  29.25 
 
 		 609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  29.03 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.69 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  29.27 
 
 		 782 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.76 
 
 		 587 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  34.67 
 
 		 892 aa  251  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.17 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  28.22 
 
 		 586 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  29.51 
 
 		 568 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.12 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  29.46 
 
 		 625 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  28.72 
 
 		 579 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.61 
 
 		 584 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  31.73 
 
 		 764 aa  247  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  29.46 
 
 		 625 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  29.7 
 
 		 814 aa  247  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.87 
 
 		 584 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  29.32 
 
 		 586 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  29.7 
 
 		 768 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.28 
 
 		 596 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  28.92 
 
 		 590 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.05 
 
 		 768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.26 
 
 		 591 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.45 
 
 		 628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  34.2 
 
 		 624 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.2 
 
 		 865 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.29 
 
 		 556 aa  244  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  26.82 
 
 		 598 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  29.09 
 
 		 618 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.88 
 
 		 764 aa  243  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  28.35 
 
 		 750 aa  243  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  28.55 
 
 		 770 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.74 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  28.23 
 
 		 587 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  29.78 
 
 		 628 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.33 
 
 		 571 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  29.98 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  29.54 
 
 		 593 aa  239  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.16 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  28.72 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.48 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.47 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  28.6 
 
 		 726 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  27.83 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.78 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.78 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  29.46 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  26.94 
 
 		 597 aa  238  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  28.98 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  30.25 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 577 aa  238  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 572 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.85 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.45 
 
 		 600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.12 
 
 		 572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.01 
 
 		 609 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  28.67 
 
 		 808 aa  237  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.64 
 
 		 597 aa  237  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.6 
 
 		 571 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 		 591 aa  236  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  28.64 
 
 		 636 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  29.24 
 
 		 617 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.64 
 
 		 597 aa  236  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.72 
 
 		 572 aa  236  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.6 
 
 		 571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.6 
 
 		 571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.6 
 
 		 571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  29.37 
 
 		 597 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  31.01 
 
 		 784 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.6 
 
 		 571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.67 
 
 		 628 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  28.16 
 
 		 613 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  30.61 
 
 		 601 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.6 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  30.17 
 
 		 773 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>