More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1201 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2404  ABC transporter related  63.84 
 
 		 592 aa  768    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  74.92 
 
 		 617 aa  963    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  100 
 
 		 617 aa  1262    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2488  ABC transporter related  55.91 
 
 		 596 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.25 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.39 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.9 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.85 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.25 
 
 		 586 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.85 
 
 		 586 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 		 586 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.1 
 
 		 566 aa  293  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.87 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.78 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.09 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.92 
 
 		 578 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.92 
 
 		 578 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.43 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  31.1 
 
 		 617 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  29.44 
 
 		 584 aa  277  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  31.13 
 
 		 580 aa  276  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.26 
 
 		 587 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.88 
 
 		 594 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  31.37 
 
 		 609 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.23 
 
 		 571 aa  273  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.71 
 
 		 597 aa  273  9e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  30.2 
 
 		 603 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.51 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  27.88 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.85 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.88 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  30.95 
 
 		 784 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  29.73 
 
 		 768 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  29.35 
 
 		 814 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.88 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.88 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.88 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  30.12 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.98 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  29.9 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 		 624 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.12 
 
 		 556 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  29.16 
 
 		 602 aa  267  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.88 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.71 
 
 		 571 aa  267  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  31.42 
 
 		 620 aa  267  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 598 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.8 
 
 		 609 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  35.28 
 
 		 468 aa  266  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.59 
 
 		 768 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.16 
 
 		 600 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.71 
 
 		 620 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  28.45 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  30.24 
 
 		 782 aa  265  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.88 
 
 		 595 aa  265  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.76 
 
 		 589 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  27.54 
 
 		 571 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  30.93 
 
 		 589 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.47 
 
 		 589 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.71 
 
 		 571 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.06 
 
 		 597 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  29.19 
 
 		 591 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.6 
 
 		 588 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.06 
 
 		 597 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.66 
 
 		 575 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.27 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  29.7 
 
 		 784 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  30.39 
 
 		 572 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.44 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  30.74 
 
 		 577 aa  261  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.35 
 
 		 577 aa  261  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  32.78 
 
 		 607 aa  260  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.65 
 
 		 627 aa  260  6e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.22 
 
 		 598 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.48 
 
 		 603 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.35 
 
 		 602 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  28.85 
 
 		 672 aa  259  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.49 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  31.61 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.97 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.04 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  30.56 
 
 		 624 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  27.34 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.19 
 
 		 602 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.8 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  29.8 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.28 
 
 		 596 aa  257  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  28.15 
 
 		 584 aa  256  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.19 
 
 		 602 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.47 
 
 		 598 aa  256  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.06 
 
 		 586 aa  256  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  32.94 
 
 		 598 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.27 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  28.21 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 		 572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  33.53 
 
 		 597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>