More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1304 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  74.92 
 
 
617 aa  947    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2404  ABC transporter related  62.69 
 
 
592 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  100 
 
 
617 aa  1255    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2488  ABC transporter related  56.08 
 
 
596 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.15 
 
 
586 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.98 
 
 
586 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.69 
 
 
586 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.81 
 
 
586 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.81 
 
 
586 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 
586 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.81 
 
 
586 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 
586 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.48 
 
 
598 aa  276  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  30.33 
 
 
580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.64 
 
 
586 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.51 
 
 
578 aa  273  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.51 
 
 
578 aa  273  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.18 
 
 
586 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.83 
 
 
586 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  29.41 
 
 
617 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.34 
 
 
587 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  36.63 
 
 
468 aa  266  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.21 
 
 
575 aa  266  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.4 
 
 
589 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.1 
 
 
597 aa  264  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.22 
 
 
556 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.82 
 
 
566 aa  260  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 
566 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.33 
 
 
609 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  29.33 
 
 
610 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  34.67 
 
 
611 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  31.36 
 
 
577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.46 
 
 
598 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  29.79 
 
 
620 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.71 
 
 
600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.44 
 
 
578 aa  254  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.31 
 
 
589 aa  252  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.19 
 
 
607 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  27.53 
 
 
609 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.39 
 
 
597 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  31.61 
 
 
620 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.83 
 
 
596 aa  251  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.27 
 
 
597 aa  251  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.27 
 
 
597 aa  251  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  30.3 
 
 
609 aa  250  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  29.43 
 
 
603 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  29.98 
 
 
600 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  29.09 
 
 
603 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  28.82 
 
 
582 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  30.03 
 
 
624 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  28.6 
 
 
586 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.2 
 
 
637 aa  248  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0207  ABC transporter related  29.34 
 
 
602 aa  248  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.361271  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.91 
 
 
589 aa  247  4e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 
598 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  27.46 
 
 
768 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.3 
 
 
571 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.39 
 
 
609 aa  246  8e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  27.42 
 
 
814 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  30.32 
 
 
784 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 
618 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 
598 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  27.52 
 
 
618 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 
598 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  28.6 
 
 
579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  29.46 
 
 
588 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  26.79 
 
 
626 aa  244  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.89 
 
 
764 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.24 
 
 
584 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  27.3 
 
 
636 aa  243  6e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  27.96 
 
 
571 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
571 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02570  ABC transporter, putative  28.23 
 
 
1216 aa  242  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.31 
 
 
603 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  28.32 
 
 
591 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.96 
 
 
571 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.96 
 
 
571 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.31 
 
 
602 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.43 
 
 
602 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  31.41 
 
 
764 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
571 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
571 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  30.84 
 
 
594 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.49 
 
 
571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  26.98 
 
 
768 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  27.91 
 
 
622 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  30.66 
 
 
598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.6 
 
 
602 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  30.38 
 
 
600 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  30.43 
 
 
586 aa  240  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.7 
 
 
721 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.96 
 
 
637 aa  240  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.92 
 
 
613 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.28 
 
 
577 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  32.17 
 
 
596 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  27.73 
 
 
648 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  32.17 
 
 
596 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  31.38 
 
 
614 aa  239  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.55 
 
 
598 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  26.96 
 
 
568 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>