More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1037 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
527 aa  1057    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.44 
 
 
527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.1 
 
 
526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.97 
 
 
535 aa  298  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.26 
 
 
524 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.49 
 
 
528 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.68 
 
 
529 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  27.68 
 
 
526 aa  143  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  25.14 
 
 
527 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.15 
 
 
525 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  21.46 
 
 
541 aa  140  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  22.12 
 
 
572 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.07 
 
 
529 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25 
 
 
546 aa  133  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.58 
 
 
605 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.23 
 
 
544 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.58 
 
 
582 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  27.52 
 
 
612 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  25.47 
 
 
577 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  21.53 
 
 
546 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  23.71 
 
 
572 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.38 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  24.17 
 
 
586 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  23.89 
 
 
596 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  25.06 
 
 
704 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  26.21 
 
 
594 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.21 
 
 
727 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  23.86 
 
 
982 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.96 
 
 
608 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  26.68 
 
 
556 aa  123  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  23.35 
 
 
631 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1776  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.34 
 
 
533 aa  123  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000237655  hitchhiker  0.000000219976 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.09 
 
 
593 aa  123  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.4 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  26.34 
 
 
606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  23.4 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  26.38 
 
 
588 aa  121  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.22 
 
 
579 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  23.53 
 
 
586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  27.35 
 
 
586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  24.89 
 
 
616 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.52 
 
 
576 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.71 
 
 
608 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  26.23 
 
 
618 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.23 
 
 
586 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  24.95 
 
 
597 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  23.93 
 
 
592 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  24.31 
 
 
715 aa  120  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.76 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.04 
 
 
625 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.52 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  25.6 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.11 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  24.94 
 
 
593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.43 
 
 
581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  29.61 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  26.09 
 
 
722 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  26.98 
 
 
600 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.51 
 
 
564 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  24.02 
 
 
586 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  23.91 
 
 
597 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  25.12 
 
 
608 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.51 
 
 
564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  27.05 
 
 
725 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.85 
 
 
555 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.51 
 
 
564 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  23.89 
 
 
976 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
596 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1879  ABC transporter, ATP-binding/permease protein CydD  23.88 
 
 
592 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.63 
 
 
586 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  26.07 
 
 
548 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  24.25 
 
 
573 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  23.52 
 
 
610 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  25.62 
 
 
634 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  25.26 
 
 
595 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  25.85 
 
 
582 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  26.92 
 
 
548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.63 
 
 
586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  23.76 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  24.21 
 
 
675 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  26.05 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.26 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  24.69 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  23.98 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.26 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  25 
 
 
622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  25.36 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  23.89 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  25.45 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  25.34 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.63 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.27 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  26.11 
 
 
704 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  25.13 
 
 
610 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.03 
 
 
980 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  25.13 
 
 
610 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.98 
 
 
586 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  25.06 
 
 
582 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  23.55 
 
 
727 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.35 
 
 
641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>