More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0956 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
535 aa  1088    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1038  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.22 
 
 
526 aa  351  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000482306  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.77 
 
 
527 aa  323  6e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1037  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.42 
 
 
527 aa  301  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000242325  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  25.46 
 
 
541 aa  171  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.43 
 
 
529 aa  170  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
524 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  25.62 
 
 
572 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.38 
 
 
546 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  29.7 
 
 
526 aa  144  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.87 
 
 
546 aa  143  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.45 
 
 
529 aa  141  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  31.33 
 
 
721 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.68 
 
 
544 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  23.52 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.92 
 
 
594 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  24.46 
 
 
581 aa  130  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25.42 
 
 
612 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  25.42 
 
 
612 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.64 
 
 
578 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.64 
 
 
727 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  24.39 
 
 
573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.26 
 
 
593 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  22.69 
 
 
577 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.24 
 
 
583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  24.63 
 
 
571 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.26 
 
 
623 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.65 
 
 
537 aa  127  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  25.44 
 
 
577 aa  127  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.27 
 
 
580 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.84 
 
 
583 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.53 
 
 
596 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  25.75 
 
 
725 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.67 
 
 
600 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1453  ABC transporter related  24.15 
 
 
571 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1498  ABC transporter related  24.15 
 
 
571 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  27.38 
 
 
704 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.27 
 
 
575 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.27 
 
 
575 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.27 
 
 
575 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.27 
 
 
574 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.27 
 
 
574 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  28 
 
 
609 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  31 
 
 
704 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.27 
 
 
596 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.27 
 
 
596 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.55 
 
 
552 aa  123  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  23.32 
 
 
605 aa  123  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.02 
 
 
525 aa  123  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.65 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl118  multidrug ABC transporter  25.19 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  24.68 
 
 
622 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.76 
 
 
718 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  23.52 
 
 
585 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.28 
 
 
592 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  28.29 
 
 
727 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  24.25 
 
 
571 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  32.44 
 
 
687 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.65 
 
 
583 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  25.6 
 
 
604 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.61 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32.76 
 
 
718 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  26.22 
 
 
560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3364  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.78 
 
 
772 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.31 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  23.65 
 
 
578 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  23.65 
 
 
578 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  31.85 
 
 
610 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  24.24 
 
 
586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  29.97 
 
 
576 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  26.5 
 
 
596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.27 
 
 
579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.64 
 
 
722 aa  120  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.02 
 
 
586 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1058  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.05 
 
 
525 aa  120  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000167907  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.82 
 
 
564 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.84 
 
 
587 aa  120  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 
610 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  29.63 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
595 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  34.82 
 
 
589 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  31.51 
 
 
610 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  35.65 
 
 
726 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  23.84 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  30.87 
 
 
725 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.2 
 
 
574 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.86 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  28.18 
 
 
605 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.49 
 
 
600 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  34.69 
 
 
745 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.61 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.17 
 
 
586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50812  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial ATM1-like protien (ABCB)  26.92 
 
 
648 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.441292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  25.89 
 
 
597 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  28.25 
 
 
727 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.19 
 
 
564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.86 
 
 
625 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  30.52 
 
 
663 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.56 
 
 
586 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1466  ABC transporter related  24.18 
 
 
572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>