More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_50812 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_50812  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial ATM1-like protien (ABCB)  100 
 
 
648 aa  1320    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.441292 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05528  ABC transporter (Eurofung)  44.39 
 
 
721 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649835  normal  0.920621 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  45.77 
 
 
607 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  42.97 
 
 
623 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  44.33 
 
 
606 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  42.86 
 
 
612 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  42.86 
 
 
612 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.23 
 
 
651 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  42.81 
 
 
623 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  42.38 
 
 
655 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.81 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  42.16 
 
 
623 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  42.49 
 
 
623 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  42.26 
 
 
605 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  43.99 
 
 
654 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  42.81 
 
 
654 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  42.49 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  43.57 
 
 
646 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.81 
 
 
623 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.24 
 
 
628 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  42.16 
 
 
623 aa  479  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  42.83 
 
 
610 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  42.16 
 
 
623 aa  479  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  41.25 
 
 
612 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01920  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  41.88 
 
 
734 aa  473  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  41.77 
 
 
625 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  40.98 
 
 
612 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  42.3 
 
 
656 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  42.9 
 
 
593 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  41.98 
 
 
651 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  42.49 
 
 
629 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  42.72 
 
 
672 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  42.67 
 
 
629 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  41.53 
 
 
617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  41.65 
 
 
661 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  41.84 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.71 
 
 
627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  45.48 
 
 
608 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  42.09 
 
 
628 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  43.07 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  42.86 
 
 
652 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  41.38 
 
 
625 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  40.88 
 
 
607 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  42.55 
 
 
606 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  42.62 
 
 
608 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  41.83 
 
 
607 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  42.98 
 
 
651 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  41.83 
 
 
652 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  41.3 
 
 
625 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  43.85 
 
 
621 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.61 
 
 
628 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.61 
 
 
625 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  44.01 
 
 
595 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  41.1 
 
 
672 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  42.73 
 
 
606 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  42.54 
 
 
630 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 
591 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
577 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  41.41 
 
 
590 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  41.5 
 
 
590 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  42.19 
 
 
611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13171  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial ATM1-like protein (ABCB)  43.36 
 
 
645 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.110905  hitchhiker  0.00036774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  42.18 
 
 
621 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  41.44 
 
 
591 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  41 
 
 
657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38642  predicted protein  43.07 
 
 
587 aa  453  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.429359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  40.92 
 
 
626 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  40.93 
 
 
662 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  41.51 
 
 
655 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  40.96 
 
 
596 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  43.83 
 
 
590 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  40.96 
 
 
596 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  41.69 
 
 
603 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  41.18 
 
 
663 aa  452  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  40.99 
 
 
589 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  42.32 
 
 
606 aa  452  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  42.28 
 
 
596 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  42.81 
 
 
624 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.63 
 
 
602 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  41.91 
 
 
603 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  42.31 
 
 
598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  42.67 
 
 
647 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  40.96 
 
 
631 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  42.07 
 
 
603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  39.14 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  42.11 
 
 
594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0722  ABC transporter related  40.48 
 
 
627 aa  445  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  40.97 
 
 
640 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  42.57 
 
 
619 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  40.94 
 
 
601 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  41.78 
 
 
598 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  40.77 
 
 
597 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  41.76 
 
 
598 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  42.44 
 
 
609 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  41.93 
 
 
598 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>