More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38642 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_38642  predicted protein  100 
 
 
587 aa  1211    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.429359  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13171  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial ATM1-like protein (ABCB)  47.95 
 
 
645 aa  557  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.110905  hitchhiker  0.00036774 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05528  ABC transporter (Eurofung)  46.68 
 
 
721 aa  535  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649835  normal  0.920621 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01920  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  47.85 
 
 
734 aa  537  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  47.57 
 
 
655 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  46.56 
 
 
623 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  46.11 
 
 
640 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  45.73 
 
 
672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  46.71 
 
 
646 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  48.5 
 
 
606 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
593 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  45.28 
 
 
610 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  45.45 
 
 
623 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  46.18 
 
 
611 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  44.26 
 
 
625 aa  515  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  45.45 
 
 
623 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  45.45 
 
 
623 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.63 
 
 
628 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  46.55 
 
 
644 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  45.44 
 
 
607 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  50.2 
 
 
606 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.22 
 
 
651 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.63 
 
 
625 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.66 
 
 
627 aa  511  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  46.01 
 
 
662 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  47.05 
 
 
663 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  45.83 
 
 
606 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  44.64 
 
 
597 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  45.45 
 
 
607 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  47.82 
 
 
595 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  46.72 
 
 
647 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  45.57 
 
 
598 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  46.61 
 
 
607 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  44.6 
 
 
612 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  44.77 
 
 
612 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  45.21 
 
 
628 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  45.22 
 
 
591 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  44.54 
 
 
608 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56634  mitochondrial ABC transporter  45.03 
 
 
622 aa  507  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.718195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  45.8 
 
 
623 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  46.57 
 
 
626 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 
590 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  44.39 
 
 
621 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  45.22 
 
 
590 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.96 
 
 
628 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  44.98 
 
 
629 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  45.7 
 
 
623 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  45.63 
 
 
623 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  46.05 
 
 
609 aa  505  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  47.28 
 
 
606 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  45.08 
 
 
605 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  45.11 
 
 
603 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  44.85 
 
 
631 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  44.35 
 
 
591 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  44.46 
 
 
596 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  44.1 
 
 
590 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  45.33 
 
 
596 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  45.81 
 
 
629 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  43.84 
 
 
622 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  44.83 
 
 
655 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  44.92 
 
 
624 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  44.09 
 
 
612 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  44.43 
 
 
612 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  44.87 
 
 
598 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  46.31 
 
 
654 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  44.87 
 
 
598 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
577 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  45.33 
 
 
596 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 
589 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  44.52 
 
 
598 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  44.7 
 
 
598 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  45.14 
 
 
656 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  45.33 
 
 
631 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.45 
 
 
623 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.45 
 
 
623 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  43.95 
 
 
652 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  45.45 
 
 
654 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.45 
 
 
623 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  44.01 
 
 
617 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.45 
 
 
623 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 
630 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  44.58 
 
 
603 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  43.77 
 
 
594 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  43.6 
 
 
596 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  45.96 
 
 
672 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.45 
 
 
623 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  43.6 
 
 
598 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.45 
 
 
623 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  43.64 
 
 
608 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 
592 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  43.94 
 
 
651 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
603 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  44.24 
 
 
637 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  43.95 
 
 
625 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  43.84 
 
 
621 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  43.61 
 
 
625 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  44.31 
 
 
657 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  45.13 
 
 
619 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  45.78 
 
 
624 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0722  ABC transporter related  44.07 
 
 
627 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>